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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003348`

染色体: Chr02 坐标: 54685360-54688297 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003348`
名称	SmilChr02G003348
描述	RING-H2 finger protein ATL58-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	54685360 - 54688297 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010379`
GeneID	`131010379`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010379`
原始查询	`LOC131010379`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL58-like
产物	RING-H2 finger protein ATL58-like
Arabidopsis	`AT4G10150` (AT4G10150) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826606] identity=60.9; qcov=0.726; evalue=5.45e-62; confidence=high
Rice	`Os02g0557300` - identity=65.4; qcov=0.654; evalue=3.22e-48; confidence=medium
GO	GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0016740 (transferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12678 (zf-rbx1); PF13445 (zf-RING_UBOX); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010379

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057793862.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793862.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057793862.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057793862.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057793862.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:54685845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr2:54686655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B34
`Chr2:54686798`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	27	A15,A23,A4,A7,A9,B109,B113,B118,B128,B27,B38,B39,B47,B71,C25,C29,C47,C49,C6,C62,C75,C79,C8,D1,D11,D4,D8
`Chr2:54686802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793862.1

208 aa

104

208

zf-RING_2

zf-RING_11

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

zf-C3HC4_2

zf-rbx1

PF13639 zf-RING_2 110-153 aa PF17123 zf-RING_11 111-139 aa PF13445 zf-RING_UBOX 111-150 aa PF00097 zf-C3HC4 111-152 aa PF13923 zf-C3HC4_2 111-152 aa PF12678 zf-rbx1 126-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793862.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	110	153	5.7e-14	52.8	Ring finger domain
`XP_057793862.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	111	139	1.2e-07	32.0	RING-like zinc finger
`XP_057793862.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	111	150	1.3e-06	29.0	RING-type zinc-finger
`XP_057793862.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	111	152	4.5e-06	27.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057793862.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	111	152	1e-06	29.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057793862.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	126	153	2.4e-08	34.8	RING-H2 zinc finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937879.1
ATATCTAACAAATAATACTACTTAATATTTTGGTGATGTTCCATAGAGACAAAACAAATGTCATATGTTGTAATATTTGATACCCTATCTAATCTTACAAGCTTGACATTTCACCGATCGCCGTTGCCAAATAGGGAGATCGGTACATGAAGAAACTGACAATACGAGATTTTATGAGAGAGAAACTTGCTCTGGACAGCTCAATTGCCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCCACTTTATCTATTTAGGTGTGTGTGTGTAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010379
ATGTCGAAAAATAGGAATTCAGAGCGAGAAATAGGTAGCAGCAGCAATGGTAGCAGCAGTTGTTGCTCGAATGCATCTTCTCAGCTGAAAATCTACCAAACATTCATATTCTCAGTCCCAATTTTCTTCACATTTATACTTCTCTTCTTGTTTTATTGGTTCTATCTCCGGCGGCGACGGGCGGACTGGTCTTCTCTCAGAATGAGGGCTAATAATTCCGTTCTAATCGGCGATGATATCTCCAGGTGTGAGCTTGGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793862.1
MSKNRNSEREIGSSSNGSSSCCSNASSQLKIYQTFIFSVPIFFTFILLFLFYWFYLRRRRADWSSLRMRANNSVLIGDDISRCELGLKKELREMLPIIVFNHSFSVKDTLCSVCLGEYLAEDKLQQIPSCGHTFHMDCIDLWLTIHTTCPLCRHSLLAPTLHQQTQTNQDPQTSDPPSETDEGLVAIARDQHDDPEAQTQRGVMETVK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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