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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003422`

染色体: Chr02 坐标: 55428480-55432464 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003422`
名称	SmilChr02G003422
描述	lysine histidine transporter-like 8
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55428480 - 55432464 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010399`
GeneID	`131010399`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010399`
原始查询	`LOC131010399`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine histidine transporter-like 8
产物	lysine histidine transporter-like 8
Arabidopsis	`AT1G47670` (AT1G47670) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841177] identity=88.4; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0485600` (OsLHT4A) - identity=75.2; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010399

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793882.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057793882.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057793882.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793882.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793882.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55429081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C86
`Chr2:55429633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B42,B43
`Chr2:55429855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:55430065`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B61
`Chr2:55430065`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B61
`Chr2:55430702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:55431789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B140,B36
`Chr2:55431819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B14,B26
`Chr2:55431853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793882.1

519 aa

260

519

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 96-507 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793882.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	96	507	1e-60	206.3	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937899.1
TCCAATGAAATAATGTGTTTCATCAGACACTTAGAAATAGTTTTATGAAAATAAATATTTTTGGACATGAATAGTAGGTATATATTTATGGATTAAAACATAAAGCAACATAAAGGAGGGAGTTTGTGAATAGAATTTGGTATGGCATGATAGCGATTCCACGCCGAGTCCCCCACCCACTCCAGATTACTCATTCATGCCTCGCTACAATTTCAAAACTCCAGTCAGACCTCAGACTCACAGGTCCCACCTCTCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010399
ATGGAGGAGAGACCAGAAACGGAGTTGATATCCATACCGGCGACGCCACGCGCCTCGACGCCGGAGATACTGACTCCGTCGGGGCAGAGGTCGCCGCGGAAGGAGGCAGGGGTGAGCACCGCCAAGTCGTGGACCCCGACGTCCTTCATTTCCCCCCGGTTCCTCAGCCCCATCGGCACCCCCATGAAGAGGGTGCTGGTAAACATGAAAGGCTATTTGGAGGAGGTCGGCCACCTCACCAAGCTCAACCCCCAAGACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793882.1
MEERPETELISIPATPRASTPEILTPSGQRSPRKEAGVSTAKSWTPTSFISPRFLSPIGTPMKRVLVNMKGYLEEVGHLTKLNPQDAWLPITESRNGNAHYAAFHNLNAGVGFQALLLPVAFSFLGWSWGIISLIIAYFWQLYTLWILVQLHEAVPGKRYNRYVELAQAAFGERLGVWLALFPTVYLSAGTATALILVGGETMKLFFQIVCGPLCSSNPLTTVEWYLVFTSLCIVLSQLPNLNSIAGLSLVGAVTAITYC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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