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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003426`

染色体: Chr02 坐标: 55461968-55465967 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003426`
名称	SmilChr02G003426
描述	probable transcription factor KAN4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55461968 - 55465967 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010403`
GeneID	`131010403`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010403`
原始查询	`LOC131010403`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable transcription factor KAN4
产物	probable transcription factor KAN4
Arabidopsis	`AT5G42630` (ATS) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834270] identity=59.6; qcov=0.843; evalue=4.02e-56; confidence=high
Rice	`Os03g0766500` (OsKANADI4) - identity=48.6; qcov=0.83; evalue=4.41e-42; confidence=medium
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0010158 (abaxial cell fate specification)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010403

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793887.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793887.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793887.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793887.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793887.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55462173`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B101,B53,B56,B96
`Chr2:55462173`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B101,B53,B56,B96
`Chr2:55462176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr2:55462249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	90	A13,A21,A24,A3,A5,A6,A7,A8,B10,B100,B102,B106,B107,B108,B109,B114,B117,B12,B121,B124,B13,B130,B132,B134,B136,B138,B16,B17,B19,B2,B20,B22,B23,B24,B30,B33,B35,B4,B47,B52,B57,B59,B65,B66,B70,B73,B75,B77,B8,B86,B87,B89,B90,B92,B93,B95,B99,C1,C10,C12,C15,C19,C20,C21,C26,C28,C29,C33,C34,C35,C38,C42,C46,C48,C50,C6,C70,C72,C73,C75,C76,C78,C8,C81,C84,C85,C87,D3,D6,D8
`Chr2:55462253`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B1,B14,B26
`Chr2:55462253`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B1,B14,B26
`Chr2:55463946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B1,B14
`Chr2:55463946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B14
`Chr2:55463995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:55464018`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	133	A10,A14,A16,A24,A25,A3,A5,A6,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B109,B110,B111,B114,B118,B119,B12,B120,B123,B125,B126,B127,B13,B130,B133,B134,B136,B138,B14,B16,B17,B20,B21,B24,B25,B28,B3,B31,B33,B35,B36,B38,B39,B42,B43,B47,B48,B52,B54,B57,B58,B59,B64,B66,B69,B77,B8,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B97,B99,C1,C10,C14,C15,C19,C20,C21,C24,C26,C27,C28,C29,C30,C33,C36,C38,C39,C41,C42,C46,C48,C49,C50,C51,C53,C54,C56,C59,C6,C60,C61,C62,C65,C69,C71,C72,C73,C75,C76,C78,C79,C8,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D8
`Chr2:55464036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B64,B70
`Chr2:55464090`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A14,A6,B102,B110,B118,B123,B127,B133,B14,B36,B41,B57,B58,B81,B88,B9,C10,C11,C42,C51,C54,C56,C65,C69,C71,C76,C9,D11,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793887.1

287 aa

144

287

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 98-149 aa

XP_057793888.1

275 aa

138

275

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 98-149 aa

XP_057793889.1

223 aa

112

223

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 98-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793887.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	98	149	9e-07	29.6	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057793888.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	98	149	8.3e-07	29.7	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057793889.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	98	149	6.2e-07	30.2	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937905.1
GTCTCTGTCAATCAATTTATTATTTGAGATGGGAGTTATGTAAAGAACACTATTTTATTATCTCTAATTTGTTTTCTCGAAAACCAACCATTCTTCCCTAATCGATCCATTCCCTCCTCCACACCACCCCTACCCACTCCCTTCTCTCTCTCTCTGCTTCCTTATATACAAAATTTCCCTTTTCACATACTTTTTCTTTCCTGATTGCAAAAACCCCTTTCTCCTTTTTTCCCCAGAATTAATTATTGACGCTTGTTTCT...

XM_057937906.1
GAAAACCAACCATTCTTCCCTAATCGATCCATTCCCTCCTCCACACCACCCCTACCCACTCCCTTCTCTCTCTCTCTGCTTCCTTATATACAAAATTTCCCTTTTCACATACTTTTTCTTTCCTGATTGCAAAAACCCCTTTCTCCTTTTTTCCCCAGAATTAATTATTGACGCTTGTTTCTGCAAAACTCCTTTTAAGCCTTTCCTTGTGGGATATCTTTTCAAACCTAGCCTAACTAAGCCTACACCACATCTCTCTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131010403
ATGTATCTGAGCTCAAACACGCCCGATCTCTCCTTACAGATCAGTCCGCCCTCAGCGACACAAACACCCCGTGATCGGAGCTCCACCGCCGATTCCGCCAGCAGTGGCGGCAGCGATTTGAGCCACGAAAATGGTATTTTCAACAATCAAGTTGTTGAGCCCACTCTGCGCCTAGGGTTCGATGTACCTCGCCACTATCAGCCTCAGATGTATGGAGGAAGAGAGTTCAAGAGAAGCTCCAGAGCCACAATTAATGGCGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057793887.1
MYLSSNTPDLSLQISPPSATQTPRDRSSTADSASSGGSDLSHENGIFNNQVVEPTLRLGFDVPRHYQPQMYGGREFKRSSRATINGGVGVRRSVRAPRMRWTTTLHSHFVHAVQLLGGHERATPKSVLELMNVKDLTLAHVKSHLQMYRTVKSTDKGTDIGPKLHTTRIEDEKDEDPCTVIAPLVAAPPPPPLSLSLLHIQHAQRWVHFSDSLAISFYFLIFALISCLLFLTHSYIANYTTTSFLTCNFTFPQKLKKTCN...

XP_057793888.1
MYLSSNTPDLSLQISPPSATQTPRDRSSTADSASSGGSDLSHENGIFNNQVVEPTLRLGFDVPRHYQPQMYGGREFKRSSRATINGGVGVRRSVRAPRMRWTTTLHSHFVHAVQLLGGHERATPKSVLELMNVKDLTLAHVKSHLQMYRTVKSTDKGTDIGPKLHTTRIEDEKDEDPCTVIAPLVAAPPPPPLSLSLLHIQHAQRRPLSIDDLILRPSSHLHAPKPNLPQLDISKEYGVGGVGKSSSSDVLVDLEFKLGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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