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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003440`

染色体: Chr02 坐标: 55674626-55678393 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003440`
名称	SmilChr02G003440
描述	cocosin 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55674626 - 55678393 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010415`
GeneID	`131010415`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010415`
原始查询	`LOC131010415`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cocosin 1-like
产物	cocosin 1-like
Arabidopsis	`AT1G07750` (AT1G07750) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837290] identity=38.6; qcov=1.04; evalue=3.08e-84; confidence=medium
Rice	`Os05g0116000` - identity=37.7; qcov=1.04; evalue=6.46e-79; confidence=medium
GO	GO:0045735 (nutrient reservoir activity)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010415

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057793913.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057793913.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793913.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057793913.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793913.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55675722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B69
`Chr2:55675858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B42,B43
`Chr2:55675971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr2:55676008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:55676015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B67
`Chr2:55676015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:55678141`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C31
`Chr2:55678141`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793913.1

333 aa

166

333

Cupin_1

PF00190 Cupin_1 12-160 aa PF00190 Cupin_1 216-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793913.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	12	160	3.9e-39	134.3	Cupin
`XP_057793913.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	216	326	3.9e-39	134.3	Cupin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937930.1
ATTATTGGCGAATGGCGACAGTTTACAGAAATTTAAATATTGTGTCTATTATATATAGGGGCAGGGGCCATCTTACGTTCGTACCTCTAACAATATTGCATCTGGCGAATTGAAGTGAATTTGATGGAGTTCCATTTACAACCCCAAAAGGCTGACACCACCGTATTTGAAGGAGAAGGTGGCGGTTACTACGCATGGACACCACCCAAAACTCCGGTGGTTGAGGAGGCGGTGATCGGCGCCGGTAGACTTGTTTTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010415
ATGGAGTTCCATTTACAACCCCAAAAGGCTGACACCACCGTATTTGAAGGAGAAGGTGGCGGTTACTACGCATGGACACCACCCAAAACTCCGGTGGTTGAGGAGGCGGTGATCGGCGCCGGTAGACTTGTTTTACAGCCACAAGGCTTCGCTCTGCCTCACTATGCCGACGCTTCCAAGATTGGTTACGTCATCCAAGGTAGGTGCACCGTAGGACTCATATTGGCAGACAAAGACAAGCCAGAAGAGAAAGTCGTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793913.1
MEFHLQPQKADTTVFEGEGGGYYAWTPPKTPVVEEAVIGAGRLVLQPQGFALPHYADASKIGYVIQGRCTVGLILADKDKPEEKVVIINEGDAIPVKIGSISWWYNGGDSDVSIIFLGESSQSHSRGQFDYFFLSGAIGILRGLSTEFVSKMYGLSGEQSKELVESQSNALVVKIGATIHLPQESNCKQEEYIISSLGVGVEMTSPLVDEVGLTPKLVRLEADTMLDPYYSMAHQIMYVTKGGGRIQMVGLNGARVLDEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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