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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003449`

染色体: Chr02 坐标: 55730022-55732077 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003449`
名称	SmilChr02G003449
描述	allene oxide synthase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55730022 - 55732077 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010424`
GeneID	`131010424`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010424`
原始查询	`LOC131010424`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	allene oxide synthase 1, chloroplastic-like
产物	allene oxide synthase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G42650` (AOS) allene oxide synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834273] identity=63.8; qcov=0.917; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0767000` (AOS1) - identity=60.8; qcov=0.904; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009695 (jasmonic acid biosynthetic process); GO:0009941 (chloroplast envelope); GO:0016125 (sterol metabolic process); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010424

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057793921.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057793921.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057793921.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793921.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793921.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55730277`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	110	A11,A15,A16,A18,A19,A22,A25,A3,A4,A7,A8,B101,B103,B114,B118,B119,B12,B122,B123,B128,B134,B136,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B21,B23,B24,B25,B29,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B41,B45,B46,B48,B51,B53,B54,B56,B58,B60,B62,B63,B64,B65,B7,B76,B78,B85,B87,B9,B90,B92,B95,B96,B98,C10,C11,C12,C14,C15,C18,C19,C21,C25,C26,C32,C33,C35,C38,C39,C42,C46,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C59,C6,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C71,C73,C74,C76,C77,C80,C82,C83,C84,C9,D3,D6,D8,D9
`Chr2:55730295`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A9,C75,D1
`Chr2:55730295`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A9,C75,D1
`Chr2:55730490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C79
`Chr2:55730679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B91,C87,D2,D7
`Chr2:55730758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:55730919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B89
`Chr2:55731009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C72
`Chr2:55731012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:55731145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,D10
`Chr2:55731187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:55731303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793921.1

551 aa

276

551

p450

PF00067 p450 381-484 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793921.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	381	484	1.3e-12	47.9	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937938.1
TCACCTTCAATTTTATTTATCGCTTGAGATCCATGTGGTCAAACTCTCCATATACAGTTATATAATAATAAAGTGAAACCTAGCTAATGGGCCATCTTCTCCACTTATTAATTCTCTTCCTAAATTATTCATTCATTAATTCTCTCTCTCATATAGATATCATATGCTCTCCCACCAATTCTCTCTCATATATATCATATGCTCTCCCACCATACTTGCACAATTATTCATCACCAATTTTGTACTAGAATTATTAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010424
ATGCTCTCCCACCAATTCTCTCTCATATATATCATATGCTCTCCCACCATACTTGCACAATTATTCATCACCAATTTTGTACTAGAATTATTAATCATGGCTGCTTCCTCTTCTCTATCCACTCTCTCTTGTTTCTCCACTTGCAGTCTCCCATCTTCTTCCCAAACCAAACCACCACGAAAAGTGGCTTTGCGGCTCATCACCGCCACCTTATCGGAAAAGCCACCGACCTCGAAACCAGCGGCGCCGGCGAAACTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793921.1
MLSHQFSLIYIICSPTILAQLFITNFVLELLIMAASSSLSTLSCFSTCSLPSSSQTKPPRKVALRLITATLSEKPPTSKPAAPAKLPMRKIPGDYGLPLIGPWRDRQDYFYNQGRDEFFKSRIQKYQSTVYRTNMPPGPFISFRPNVVALLDGKSFPALFDTDNVEKRDLFTGTFMPSTDLTGGYRTLSYLDPSEPNHAKLKNLMFFMLSSRRDHVIPEFHATYVQMFQGLEAELAAKGKASFGAANDVAAFNFLARSFY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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