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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003816`

染色体: Chr01 坐标: 56526006-56526977 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003816`
名称	SmilChr01G003816
描述	uncharacterized SmilChr01G003816
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56526006 - 56526977 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010427`
GeneID	`131010427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010427`
原始查询	`LOC131010427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G02520` (AT2G02520) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814782] identity=24.4; qcov=0.418; evalue=2e-07; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=24.6; qcov=0.957; evalue=8.64e-11; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793926.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057793926.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057793926.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057793926.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793926.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56526013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C77
`Chr1:56526019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B12,B4,C36,C53
`Chr1:56526019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B4,C36,C53
`Chr1:56526024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B104,C61
`Chr1:56526036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:56526056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B21,B55,C85
`Chr1:56526065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B20,C5
`Chr1:56526065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C5
`Chr1:56526068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,C18,C21,C29
`Chr1:56526070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B3,C3,C83
`Chr1:56526072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B84
`Chr1:56526080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B15,C3,C77,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793926.1

323 aa

162

323

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 125-219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793926.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	125	219	6e-15	56.4	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937943.1
ATGAAATCCGAATGGTGGGCGAAAGTGATTGAGGAGGGAGGGAGGGGAACGGATGCGTGGTTCAGAGAGAACATCAGTCGTAGGCTTGGAAACGGGCGGGAGACAAATTTCTGGGACCATCCTTGGGCGGGACCGGAACTCTTAAAACACAAGTTCCCTAGATTCTTTAGGCTTAGTTTGAGGAGGGATGTCAAAGTCGAGGAGTGCGGGAGATGGGAGGAGGGGAGCTGGAAGTGGGAGCTCAAGTGGCGTCGGACGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010427
ATGAAATCCGAATGGTGGGCGAAAGTGATTGAGGAGGGAGGGAGGGGAACGGATGCGTGGTTCAGAGAGAACATCAGTCGTAGGCTTGGAAACGGGCGGGAGACAAATTTCTGGGACCATCCTTGGGCGGGACCGGAACTCTTAAAACACAAGTTCCCTAGATTCTTTAGGCTTAGTTTGAGGAGGGATGTCAAAGTCGAGGAGTGCGGGAGATGGGAGGAGGGGAGCTGGAAGTGGGAGCTCAAGTGGCGTCGGACGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793926.1
MKSEWWAKVIEEGGRGTDAWFRENISRRLGNGRETNFWDHPWAGPELLKHKFPRFFRLSLRRDVKVEECGRWEEGSWKWELKWRRTLRETEMEAVNLLTSFISPFVLIADSDDGWSWSASTDGKFTTKLAYEAIKTRRSEITAQSTEALAAASVWQTLAPQKAVVNAWIILRRRLPTCDELRKWNINLGDGEVVCKQCFSHNESINHVFTLCSRTQEVWNEIQLWIGIQIARPSTSVEHWRSFCYFCKNKTIGKLLKAIW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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