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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003458`

染色体: Chr02 坐标: 55869100-55871534 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003458`
名称	SmilChr02G003458
描述	uncharacterized SmilChr02G003458
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55869100 - 55871534 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010433`
GeneID	`131010433`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010433`
原始查询	`LOC131010433`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA glycosylase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843846]; symbol=AT1G75090; hit=AT1G75090; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DNA glycosylase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843846]; symbol=AT1G75090; hit=AT1G75090; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G75090` (AT1G75090) DNA glycosylase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843846] identity=50.8; qcov=0.994; evalue=3.2e-107; confidence=high
Rice	`Os03g0198900` (TagI) - identity=62.9; qcov=0.621; evalue=2.49e-87; confidence=high
GO	GO:0006284 (base-excision repair); GO:0008725 (DNA-3-methyladenine glycosylase activity)
KEGG	smil03410 (Base excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03352 (Adenine_glyco)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010433

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793933.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793933.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793933.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793933.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793933.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55869586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D7
`Chr2:55869591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:55869641`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D6
`Chr2:55869641`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D6
`Chr2:55870901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C22,C55,C86
`Chr2:55871011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B69
`Chr2:55871016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C6
`Chr2:55871038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793933.1

317 aa

158

317

Adenine_glyco

PF03352 Adenine_glyco 130-298 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793933.1`	Pfam	`PF03352`	Adenine_glyco	Family	130	298	1.8e-61	207.8	Methyladenine glycosylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937950.1
TACAGCGTTTCAATCTTATACTTACATCTATGTTTTTACTTGTTTGGTGAATCCAAAACTATGGCAACATCGAGATATCTTTCAAACTTCCCACCCCGCCTACCGCCAAGAAAGGGGGACACATCATCACTTACTGGCTATCACCGGTCACCGTATCCAAATAGTCCCTTATAAGGTTCAGTCTCCCCTCTACCCCGAAACATTTGTCTTCCCTTTTCGCCCTCAACTTCTCTTCTAATTCCACACTGTTTAAACTTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010433
ATGTCTACTGCCACTGAAAAAACCGGAACCGAAACCCGGTGTATACTCGCTCCGACAGGAAATCGGGTTCGGATTCATGAAGAACGGAGGCGAAGAAACGAGATGATGAAGAAGCCACCGGAGAAGCCTAAGAAAGTAGCTGCGGCGAAACCTGCTGCCGCTGTTGTGCGGTGCGACGTCTCAGTTGATAACTCCTCCGACTCTTCTTCCTCGGCTTCATCGCCCAGTGGTTCAATGGTGAAATCTGCTAAAAACAATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793933.1
MSTATEKTGTETRCILAPTGNRVRIHEERRRRNEMMKKPPEKPKKVAAAKPAAAVVRCDVSVDNSSDSSSSASSPSGSMVKSAKNNSWRLMENDNGVVRAATTVPDGVGALSLSPAVPLPVKRCDWITPNSEPLYASFHDEEWGVPVNDDVKLLELLVFSQALAELSWPLILSKRAEFRKVFNAFDPTSLANLDDKRLLSIRLLSEPKVRAIVDNAKQLLKIQQEFGSFSNYCWRFVNHKPIKSGFRYARQVPAKTPKSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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