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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003459`

染色体: Chr02 坐标: 55893638-55894763 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003459`
名称	SmilChr02G003459
描述	peroxisomal membrane protein 11A
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	55893638 - 55894763 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010434`
GeneID	`131010434`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010434`
原始查询	`LOC131010434`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxisomal membrane protein 11A
产物	peroxisomal membrane protein 11A
Arabidopsis	`AT1G47750` (PEX11A) peroxin 11A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841186] identity=60.3; qcov=0.95; evalue=4.68e-100; confidence=high
Rice	`Os03g0302000` (PEX11-3) - identity=54.3; qcov=0.985; evalue=7.15e-75; confidence=high
GO	GO:0005778 (peroxisomal membrane); GO:0016559 (peroxisome fission); GO:0044375 (regulation of peroxisome size)
KEGG	-
Pfam	PF05648 (PEX11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010434

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057793934.1`
2	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	0.80000	`XP_057793934.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057793934.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793934.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:55893837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr2:55893855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C16,C61
`Chr2:55894001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C5
`Chr2:55894009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B56,B96
`Chr2:55894026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C16,C61
`Chr2:55894167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B35,B36,C36
`Chr2:55894350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C5
`Chr2:55894380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:55894494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,C86
`Chr2:55894498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B120,B77,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793934.1

260 aa

130

260

PEX11

PF05648 PEX11 29-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793934.1`	Pfam	`PF05648`	PEX11	Family	29	257	4.7e-44	151.2	Peroxisomal biogenesis factor 11 (PEX11)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937951.1
TTGTGGAAAATAGGAAAATAGCAATAAAATAAATCTTCAGGCACGCAAATCAAGATGAAGATCTCTTTAGTCATCGCTTTCTCGCTCGAGCTTAAAAACACCCTTGTCGGAATTTCCCACCAACTAAACGATCTTCAAATTCATAATTACTTCTTCATCTCTCAATTCTCATGGATTCAAACCCCGATCGCAAACCCCCGAACCCCAATTCTCCCCCGAAATCCGCACCCAAGAACCAGAAGGATTTCTTAATCCACCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010434
ATGGATTCAAACCCCGATCGCAAACCCCCGAACCCCAATTCTCCCCCGAAATCCGCACCCAAGAACCAGAAGGATTTCTTAATCCACCTCGAAATCTACTTGGCCAAGCGCGACGGCGTCGACAAGCTGCTCAAAATCTCGCGCTACGCCGCCAAGATCGCCCTCGCCTCCTCCCTCCTCCGCCACCAGAAGCCGCTCGCCGCCCGCCTCAAATCCTTCGAGTCGAGCGTCGGCGTCAGCCGTAAGGCCTTCCGCCTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793934.1
MDSNPDRKPPNPNSPPKSAPKNQKDFLIHLEIYLAKRDGVDKLLKISRYAAKIALASSLLRHQKPLAARLKSFESSVGVSRKAFRLGKFVQDVNALRAIHFASHSRLNLIPSAVAYGGEGFYYFIEQLVWLGKAGLIDKRHLQALQKWSAWCEFVGYFGSVSLKVMELREIEVEERCTASSVDVAVVRGIKCVEEQEKLRKLREKKVMKRLSVVQDLADGLMALADIRDGGGGVLASPLLLSSAGMLSALISTHKNWVSC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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