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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003850`

染色体: Chr01 坐标: 56795583-56796572 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003850`
名称	SmilChr01G003850
描述	uncharacterized SmilChr01G003850
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56795583 - 56796572 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010435`
GeneID	`131010435`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010435`
原始查询	`LOC131010435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=28.7; qcov=0.413; evalue=9.64e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=23.5; qcov=0.957; evalue=4.76e-10; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010435

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793939.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057793939.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057793939.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057793939.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793939.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56795616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	39	A13,A14,A6,B1,B113,B123,B124,B133,B14,B17,B18,B28,B34,B37,B50,B54,B8,B85,B88,B89,C11,C14,C15,C17,C40,C47,C57,C58,C59,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C74,C83,D4,D9
`Chr1:56795668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,A3,B49,C25
`Chr1:56795670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	54	A13,A14,A6,B1,B104,B113,B122,B123,B124,B130,B14,B15,B17,B18,B28,B34,B37,B45,B50,B54,B63,B8,B85,B88,B89,B93,B94,C10,C11,C14,C15,C17,C19,C28,C40,C47,C51,C57,C58,C59,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C74,C77,C79,C83,C87,C9,D4,D9
`Chr1:56795671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	58	A1,A14,A15,A25,B110,B111,B115,B119,B120,B127,B136,B138,B2,B25,B33,B34,B36,B41,B42,B43,B45,B48,B52,B54,B58,B6,B60,B71,B77,B8,B88,B91,B97,B98,C13,C20,C23,C24,C27,C29,C32,C35,C38,C4,C48,C49,C51,C55,C56,C63,C67,C68,C7,C72,C76,C9,D5,D8
`Chr1:56795680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr1:56795706`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B55
`Chr1:56795706`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B55
`Chr1:56795725`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A13,B130,B15,C77,C79
`Chr1:56795725`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A13,B130,B15,C77,C79
`Chr1:56795730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C5
`Chr1:56795733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:56795743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,A3,B49,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793939.1

329 aa

164

329

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 125-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793939.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	125	225	8e-14	52.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937956.1
ATGAAATCCGGATGGTGGGCGAAAGTGATTGAGAAGGGAGGGAGGGGAACGGATGCGTGGTTAAGGGAGAACAGCAGTCGTAGGCTTGGAAACGGGCGGGAGACAAATTTCTGGGACCATCCTTGGGCGGGACCGGAACTCTTAAAACACAAGTTTCCTAGATTCTTTAGGCTTAGTTTGAGGAGGGATGTCAAAGTCGAGGAGTGCGGGAGATGGGAGGAGGGGAGCTGGAAGTGGGAGCTCAAGTGGCGTCGGACGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010435
ATGAAATCCGGATGGTGGGCGAAAGTGATTGAGAAGGGAGGGAGGGGAACGGATGCGTGGTTAAGGGAGAACAGCAGTCGTAGGCTTGGAAACGGGCGGGAGACAAATTTCTGGGACCATCCTTGGGCGGGACCGGAACTCTTAAAACACAAGTTTCCTAGATTCTTTAGGCTTAGTTTGAGGAGGGATGTCAAAGTCGAGGAGTGCGGGAGATGGGAGGAGGGGAGCTGGAAGTGGGAGCTCAAGTGGCGTCGGACGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793939.1
MKSGWWAKVIEKGGRGTDAWLRENSSRRLGNGRETNFWDHPWAGPELLKHKFPRFFRLSLRRDVKVEECGRWEEGSWKWELKWRRTLRETEMEAVNLLTSFISPFVLIADSDDGWSWSASTDGKFTTKLAYEAIKTRRSENTAQSTEALAAQINVCHIGVWQTLAPQKAMVNAWRILRRRLPTCDELRKRNINLGDGEVVCKHCFSHNESINHVFTLCSRTQEVWNEIQLWIGIQTARPSTPVEHWRSFCYFCKNKTIGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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