当前解析结果
SmilChr02G003506| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003506 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003506 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G003506 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 56244107 - 56246122 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131010472 |
|---|---|
| GeneID | 131010472 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010472 |
| 原始查询 | LOC131010472 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | plasma membrane fusion protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834286]; symbol=AT5G42765; hit=AT5G42765; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | plasma membrane fusion protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834286]; symbol=AT5G42765; hit=AT5G42765; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G42765 (AT5G42765)plasma membrane fusion protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834286] identity=54.1; qcov=0.833; evalue=8.37e-58; confidence=high |
| Rice | Os03g0774400- identity=48.5; qcov=0.848; evalue=3.18e-49; confidence=medium |
| GO | GO:0009507 (chloroplast) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010472 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057793993.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057793993.1 |
| 3 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.40000 | XP_057793993.1 |
| 4 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.20000 | XP_057793993.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057793993.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:56245678 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,B120,B18,B77,B85 |
Chr2:56245941 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,B120,B18,B77,B85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。