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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003530`

染色体: Chr02 坐标: 56452158-56455371 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003530`
名称	SmilChr02G003530
描述	isoflavone reductase-like protein
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56452158 - 56455371 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010496`
GeneID	`131010496`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010496`
原始查询	`LOC131010496`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	isoflavone reductase-like protein
产物	isoflavone reductase-like protein
Arabidopsis	`AT1G75280` (AT1G75280) NmrA-like negative transcriptional regulator family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843865] identity=73.8; qcov=0.997; evalue=7.22e-164; confidence=high
Rice	`Os06g0472200` - identity=65.9; qcov=0.994; evalue=4.07e-146; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF05368 (NmrA); PF13460 (NAD_binding_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010496

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057794012.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057794012.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794012.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794012.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794012.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56452255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B15,B48
`Chr2:56452330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B77
`Chr2:56452368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:56452782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C53
`Chr2:56452859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:56454833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B47
`Chr2:56454836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr2:56454840`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B70
`Chr2:56454840`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B70
`Chr2:56454848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794012.1

310 aa

155

310

NmrA

Epimerase

3Beta_HSD

NAD_binding_10

PF05368 NmrA 3-306 aa PF01370 Epimerase 7-87 aa PF01073 3Beta_HSD 8-89 aa PF13460 NAD_binding_10 11-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794012.1`	Pfam	`PF05368`	NmrA	Family	3	306	3.6e-99	332.8	NmrA-like family
`XP_057794012.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	7	87	5.6e-08	33.2	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057794012.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	8	89	2.8e-05	24.0	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057794012.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	11	152	2.3e-15	57.6	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938029.1
CCGAAACTATAGTTAGGAGAGTGAGTGAGTGTGTTGTTATTGTATAATCTGAGAGGAAGATGGCGGAGAAAAGCAAGATTCTGATAATAGGTGGAACGGGGTACATCGGTAAATTCATTGTGGAAGCCAGCGCCAAATCCGGCCACCCTACCTTTGCTTTGCTGAGAGAGGCCACCATCTCCGACCCCGCCAAAGCTCCTCTCGTCCAAGGCTTTAAGGAATCTGGTGTCACCCTTCTCACTGGTGATCTGAACGATCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010496
ATGGCGGAGAAAAGCAAGATTCTGATAATAGGTGGAACGGGGTACATCGGTAAATTCATTGTGGAAGCCAGCGCCAAATCCGGCCACCCTACCTTTGCTTTGCTGAGAGAGGCCACCATCTCCGACCCCGCCAAAGCTCCTCTCGTCCAAGGCTTTAAGGAATCTGGTGTCACCCTTCTCACTGGTGATCTGAACGATCACGAGAGTTTGGTGAAAGCCATAAAACAAGTGGATGTTGTTATATCTACAGTAGGGCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794012.1
MAEKSKILIIGGTGYIGKFIVEASAKSGHPTFALLREATISDPAKAPLVQGFKESGVTLLTGDLNDHESLVKAIKQVDVVISTVGQLQLGDQVKIIAAIKEAGNVKRFLPSEFGNDVDRTRAVEPAKSAFETKAKIRRAIEAEAIPYTYVSSNYFAGYSLPTLAQPGAYAPPPPRDKVVIYGDGNAKAVFNEEHDIGTYTIKAVDDPRTLNKILYIKPPKNTYSFNELVALWEKKIGKTLEKEYIPEDQLLKKIEESPIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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