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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003537`

染色体: Chr02 坐标: 56517934-56519916 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003537`
名称	SmilChr02G003537
描述	mannan endo-1,4-beta-mannosidase 7-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56517934 - 56519916 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010505`
GeneID	`131010505`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010505`
原始查询	`LOC131010505`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mannan endo-1,4-beta-mannosidase 7-like
产物	mannan endo-1%2C4-beta-mannosidase 7-like
Arabidopsis	`AT5G66460` (MAN7) Glycosyl hydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836778] identity=58.9; qcov=0.988; evalue=1.1e-167; confidence=high
Rice	`Os01g0663300` - identity=55.8; qcov=0.923; evalue=3.28e-150; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0071704 (GO:0071704)
KEGG	smil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00150 (Cellulase); PF26410 (GH5_mannosidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010505

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057794023.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794023.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794023.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794023.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794023.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56518196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C75,D1
`Chr2:56518622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C34,C8
`Chr2:56519057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:56519141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:56519347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B45,C36
`Chr2:56519375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,D11
`Chr2:56519423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:56519473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr2:56519573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794023.1

402 aa

201

402

GH5_mannosidase

Cellulase

PF26410 GH5_mannosidase 23-352 aa PF00150 Cellulase 89-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794023.1`	Pfam	`PF26410`	GH5_mannosidase	Domain	23	352	2.1e-53	182.4	GH family 5 beta-mannosidase-like
`XP_057794023.1`	Pfam	`PF00150`	Cellulase	Domain	89	321	3.1e-13	50.5	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938040.1
CAATGGGCCTTTCTTGAAGCAAGAGAAACCACAAACCGGGTGATATGCCTTTTGACTGTCGCACAGTTCACAAATCACGGATACAAAATAAAAGGGATGAAATGCTAAAAAACAACAACATGAAACGCCGTATACCATAAAAGCCAGAAAACAGTTTTGTGAGAAACACAAAGTGAAAAAGATGAAGAATATGTGTAGGATATTGGTGATAGTTTTGGCGATGAGTGAGGCGAGAGGCGAAGATGGATTCATGAGAGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010505
ATGAAGAATATGTGTAGGATATTGGTGATAGTTTTGGCGATGAGTGAGGCGAGAGGCGAAGATGGATTCATGAGAGTTGATGGAGAGCATTTGATGCTAAACGGGAGCCCATTTTACGGAAACGGATTCAATGCATACTGGTTGATGTATGTGGCCTCCGATCCCTCTCAGCGAAGCAAAATCTCATCTGCATTTGAACAAGCCACCAATCACAGCCTCCTCATTGCAAGAACTTGGGCTTTCAGAGATGCTGGAGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794023.1
MKNMCRILVIVLAMSEARGEDGFMRVDGEHLMLNGSPFYGNGFNAYWLMYVASDPSQRSKISSAFEQATNHSLLIARTWAFRDAGDSPLQSSPGTYNQNMFQGLDYVISEAGKHNIKLILSLVDNYNYTGGKQQYVKWARNEGQNISSDDDFFTNSLVKAYYKNHIKAVLTRQNTISGIAYKDDPTIMAWELMNEPRCPTDPSGNTIQAWIEEMASYVKSIDKKHLLEVGLEGFYGHKHHKKNPHFQVGTDFLRNNQIAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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