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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003549`

染色体: Chr02 坐标: 56628840-56631445 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003549`
名称	SmilChr02G003549
描述	phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56628840 - 56631445 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010516`
GeneID	`131010516`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010516`
原始查询	`LOC131010516`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH1-like
产物	phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH1-like
Arabidopsis	`AT4G34580` (COW1) Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829610] identity=48.4; qcov=0.805; evalue=1.05e-48; confidence=medium
Rice	`Os08g0497300` (OsSNDP9) - identity=49.6; qcov=0.721; evalue=1.31e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010516

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057794046.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057794047.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057794045.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057794047.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794045.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56629135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B55,C55,C71,C80
`Chr2:56629387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B55,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794045.1

236 aa

118

236

CRAL_TRIO

PF00650 CRAL_TRIO 50-212 aa

XP_057794046.1

223 aa

112

223

CRAL_TRIO

PF00650 CRAL_TRIO 37-199 aa

XP_057794047.1

190 aa

190

CRAL_TRIO

PF00650 CRAL_TRIO 50-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794045.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	50	212	3.5e-30	105.6	CRAL/TRIO domain
`XP_057794046.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	37	199	3e-30	105.8	CRAL/TRIO domain
`XP_057794047.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	50	153	6.4e-09	36.5	CRAL/TRIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938063.1
AAATACTTCCTTTGTCCCATAAGGAGTTGGTGGTGGAGTAATTCCCAAAAATGACAAATGCACACTGTTATGGGATGTTACAAAATAGAAAGAAGTGCACTCTTATGAGAGGCAAAGAGAGTGTATATTAGAGTTAAAATTTATTAAGTCTATATGAAAAATATCATTTCTTATGAACACATGTATTTTGCGATTGAGTTCTTGGTGATTAGTACGTGTTGATCGGAGTATTTCTTTACAGGCAAGATTGAAATGAAGAA...

XM_057938062.1
AAATACTTCCTTTGTCCCATAAGGAGTTGGTGGTGGAGTAATTCCCAAAAATGACAAATGCACACTGTTATGGGATGTTACAAAATAGAAAGAAGTGCACTCTTATGAGAGGCAAAGAGAGTGTATATTAGAGTTAAAATTTATTAAGTCTATATGAAAAATATCATTTCTTATGAACACATGTATTTTGCGATTGAGTTCTTGGTGATTAGTACGTGTTGATCGGAGTATTTCTTTACAGGCAAGATTGAAATGAAGAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131010516
ATGATACAATACAATCTGCAGATTGACAGATTCAGTCCAATGGAGAAGCCAGAAACGCTGCCTGACATGCTTGATTGGAACAAAAACCTCACCACCGCCACCGCCGCCGTCAAGGACTTCGATTATAAGGAGCTGTGCGAAGTGAAGCAATACTACCCCCATGGTTACCACGGTGTAGACCGATCGGGAAGGCCTGTGTACATCGAGAGATTGGGGAAGCTCGACGTGGAGGGGCTCATGAAGATCACCACACTCGAACG...

LOC131010516
ATGGAGAAGCCAGAAACGCTGCCTGACATGCTTGATTGGAACAAAAACCTCACCACCGCCACCGCCGCCGTCAAGGACTTCGATTATAAGGAGCTGTGCGAAGTGAAGCAATACTACCCCCATGGTTACCACGGTGTAGACCGATCGGGAAGGCCTGTGTACATCGAGAGATTGGGGAAGCTCGACGTGGAGGGGCTCATGAAGATCACCACACTCGAACGTTATGTCAAGTACCAAACGCAGCAGTACGAGAAGACTAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057794045.1
MIQYNLQIDRFSPMEKPETLPDMLDWNKNLTTATAAVKDFDYKELCEVKQYYPHGYHGVDRSGRPVYIERLGKLDVEGLMKITTLERYVKYQTQQYEKTIKIRFPACSAAANKHINRSIAILDVQAVSFKSFTSPVQKVLLQLRKIFNENYPETLSEMVIVNASPGFKLLWNVVKCFLDPQTVSKIQVIGSKYQSKLLELVDPSELPDFLGGSCCCMSEGGCLNSDRGPWRDTSVA

XP_057794046.1
MEKPETLPDMLDWNKNLTTATAAVKDFDYKELCEVKQYYPHGYHGVDRSGRPVYIERLGKLDVEGLMKITTLERYVKYQTQQYEKTIKIRFPACSAAANKHINRSIAILDVQAVSFKSFTSPVQKVLLQLRKIFNENYPETLSEMVIVNASPGFKLLWNVVKCFLDPQTVSKIQVIGSKYQSKLLELVDPSELPDFLGGSCCCMSEGGCLNSDRGPWRDTSVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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