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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003574`

染色体: Chr02 坐标: 56898632-56900566 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003574`
名称	SmilChr02G003574
描述	CBS domain-containing protein CBSX3, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	56898632 - 56900566 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010537`
GeneID	`131010537`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010537`
原始查询	`LOC131010537`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CBS domain-containing protein CBSX3, mitochondrial-like
产物	CBS domain-containing protein CBSX3%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G47271` (AT1G47271) Cystathionine beta-synthase (CBS) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241044] identity=69.3; qcov=0.819; evalue=1.25e-80; confidence=high
Rice	`Os03g0737000` (OsCBSX4) - identity=56.6; qcov=0.869; evalue=5.48e-68; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00571 (CBS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010537

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057794078.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057794078.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794078.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794078.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794078.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:56899885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:56899921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr2:56899971`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A22,B121,B138,B139,B21,B23,B97,C1,C22,C41,C55,C71,C80,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794078.1

210 aa

105

210

CBS

PF00571 CBS 77-124 aa PF00571 CBS 136-191 aa

XP_057794079.1

199 aa

100

199

CBS

PF00571 CBS 66-113 aa PF00571 CBS 125-180 aa

XP_057794080.1

199 aa

100

199

CBS

PF00571 CBS 66-113 aa PF00571 CBS 125-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794078.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	77	124	1.2e-23	83.8	CBS domain
`XP_057794078.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	136	191	1.2e-23	83.8	CBS domain
`XP_057794079.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	66	113	1e-23	84.1	CBS domain
`XP_057794079.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	125	180	1e-23	84.1	CBS domain
`XP_057794080.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	66	113	1e-23	84.1	CBS domain
`XP_057794080.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	125	180	1e-23	84.1	CBS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938097.1
TTGTGCTTAAGCAAATTCAATTTGAACAAAACAATTACTTGGACATTTAAATTTTTCATTTCGCCTTGATAGAAAGACAAAGTTGGCAACAACTTAATCAAGAAAAGAACGCACTAAACTAATCCCAACAAGCAATTGATTAAGGGAATGAAACATTCTAATCCCAACTTGATATAAGGCTAATTAAGCCCTGTGTTGTGAAGTTGAATTTCTGAGCTTCAGGTCTACTAAGAAGTATTAAAGATGCAAGGCCTTGTACG...

XM_057938096.1
TTGTGCTTAAGCAAATTCAATTTGAACAAAACAATTACTTGGACATTTAAATTTTTCATTTCGCCTTGATAGAAAGACAAAGTTGGCAACAACTTAATCAAGAAAAGAACGCACTAAACTAATCCCAACAAGCAATTGATTAAGGGAATGAAACATTCTAATCCCAACTTGATATAAGGCTAATTAAGCCCTGTGTTGTGAAGTTGAATTTCTGAGCTTCAGGTCTACTAAGAAGTTATAGTATTAAAGATGCAAGGCCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131010537
ATGACCATAAGTTTTTCAGTTATAGTATTAAAGATGCAAGGCCTTGTACGATTTTGCCGTGAACATATACACATCAAGAAACAGCATCACTTACTGAACTTGATAAAGCATAGAAAAGGTGCAATGGTTGCAAGATCCTACTCGATGCCATTGCCGGAGAAGGGACTGCACAACACAACGATTGCAGAGGTGCTATCGACCAAAGGGCAAGACAGGATCGGATCCTGGGTCTGGTGTCGAACAGATGACACCGTCTATGA...

LOC131010537
ATGCAAGGCCTTGTACGATTTTGCCGTGAACATATACACATCAAGAAACAGCATCACTTACTGAACTTGATAAAGCATAGAAAAGGTGCAATGGTTGCAAGATCCTACTCGATGCCATTGCCGGAGAAGGGACTGCACAACACAACGATTGCAGAGGTGCTATCGACCAAAGGGCAAGACAGGATCGGATCCTGGGTCTGGTGTCGAACAGATGACACCGTCTATGATGCTGTCAAGCAAATGGCACAGAACAACATAGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057794078.1
MTISFSVIVLKMQGLVRFCREHIHIKKQHHLLNLIKHRKGAMVARSYSMPLPEKGLHNTTIAEVLSTKGQDRIGSWVWCRTDDTVYDAVKQMAQNNIGSLVVLKPGEEQHIVGILTERDYLRKVIVQDRSSKYTKVGEIMTDKDKLLTVTSDTNILHAMQLMTENQIRHAPVIDGKIVGMISMVDVVRAVVEQQHGEMKRLNEFIRGDYY

XP_057794079.1
MQGLVRFCREHIHIKKQHHLLNLIKHRKGAMVARSYSMPLPEKGLHNTTIAEVLSTKGQDRIGSWVWCRTDDTVYDAVKQMAQNNIGSLVVLKPGEEQHIVGILTERDYLRKVIVQDRSSKYTKVGEIMTDKDKLLTVTSDTNILHAMQLMTENQIRHAPVIDGKIVGMISMVDVVRAVVEQQHGEMKRLNEFIRGDYY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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