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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003589`

染色体: Chr02 坐标: 57101576-57107456 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003589`
名称	SmilChr02G003589
描述	gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	57101576 - 57107456 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010553`
GeneID	`131010553`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010553`
原始查询	`LOC131010553`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial-like
产物	gamma carbonic anhydrase 2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G47260` (GAMMA CA2) gamma carbonic anhydrase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841129] identity=75.8; qcov=0.971; evalue=1.37e-160; confidence=high
Rice	`Os12g0169700` - identity=77.9; qcov=0.996; evalue=2.48e-165; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00132 (Hexapep); PF14602 (Hexapep_2); PF28366 (GAMMACA1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057794092.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057794092.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.40000	`XP_057794092.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057794092.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794092.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:57103909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B35
`Chr2:57105516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B35,C28
`Chr2:57106889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:57106946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B13
`Chr2:57107034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B135,B45,C71
`Chr2:57107072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B48,B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794092.1

272 aa

136

272

Hexapep

Hexapep_2

GAMMACA1_C

PF00132 Hexapep 119-151 aa PF14602 Hexapep_2 119-151 aa PF14602 Hexapep_2 138-169 aa PF28366 GAMMACA1_C 197-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794092.1`	Pfam	`PF00132`	Hexapep	Repeat	119	151	9.4e-17	60.6	Bacterial transferase hexapeptide (six repeats)
`XP_057794092.1`	Pfam	`PF14602`	Hexapep_2	Repeat	119	151	4.6e-08	33.4	Hexapeptide repeat of succinyl-transferase
`XP_057794092.1`	Pfam	`PF14602`	Hexapep_2	Repeat	138	169	4.6e-08	33.4	Hexapeptide repeat of succinyl-transferase
`XP_057794092.1`	Pfam	`PF28366`	GAMMACA1_C	Domain	197	261	7.3e-38	129.1	Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938109.1
TAACCCAAATAAAAATAGTATGTGAAATTGAAAAATGTAGAGTGAATCCCCAATTTACCCCGTAAATCGTTGGCTCTCCGTTCTTGCCCTATTCAATTGTGCCTTTCAGAGTCTGAAGAGCAGCTGCAGAATCCATTAAATTAGAGCACAATCACATCCCCCTTTCAATCTCAACTCATTCTTAGATCATACACTGCACAAGCAGCAAACCCACGTAATTCCGTCGAAATGGGGACCCTAGGAAGAGTGGTGTACACGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010553
ATGGGGACCCTAGGAAGAGTGGTGTACACGTTGGGGAGTTGGATTCGGCATACGGGTCAAGCCATGGATCGAGTCGGTTCCACCTTCCAGGCAGGCTACTATATCCAGGATCATATTTCTAAGCACCGGACACTGATGAACATCTATGATAAATCTCCGGTCGTGGATAAGGATGCATTTATTGCCCCAAGTGCCTCTGTCATTGGGGATGTTCAGGTGGGCCAAGGATCATCGATATGGTATGGATCTGTCCTTCGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794092.1
MGTLGRVVYTLGSWIRHTGQAMDRVGSTFQAGYYIQDHISKHRTLMNIYDKSPVVDKDAFIAPSASVIGDVQVGQGSSIWYGSVLRGDVNSISVGSGTNIQDNSLVHVAKSNLSGKVLPTIIGNNVTIGHSAVVHGCIIEDEAFVGMGATLLDGVVVEKHAMVAAGSLVRQDTRIRSGEVWAGNPAKLLRKLTEEEIEFIIKSATNYVNLAKVHAAENAKSFDEIEFEKMLRKKFARRDEEYDSMIGVVRETPPELILPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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