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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003598`

染色体: Chr02 坐标: 57171447-57173363 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003598`
名称	SmilChr02G003598
描述	mannan endo-1,4-beta-mannosidase 7-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	57171447 - 57173363 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010559`
GeneID	`131010559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010559`
原始查询	`LOC131010559`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mannan endo-1,4-beta-mannosidase 7-like
产物	mannan endo-1%2C4-beta-mannosidase 7-like
Arabidopsis	`AT5G66460` (MAN7) Glycosyl hydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836778] identity=59.2; qcov=0.988; evalue=4.63e-168; confidence=high
Rice	`Os01g0663300` - identity=55.8; qcov=0.923; evalue=3.11e-150; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0071704 (GO:0071704)
KEGG	smil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00150 (Cellulase); PF26410 (GH5_mannosidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057794100.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057794100.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794100.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794100.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794100.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:57171710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C75
`Chr2:57172136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr2:57172300`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C13
`Chr2:57172300`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C13
`Chr2:57172329`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr2:57172329`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B11
`Chr2:57172536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:57172887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:57172950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C87
`Chr2:57173046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:57173127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr2:57173172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,B5,C53,C60,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794100.1

402 aa

201

402

GH5_mannosidase

Cellulase

PF26410 GH5_mannosidase 23-352 aa PF00150 Cellulase 89-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794100.1`	Pfam	`PF26410`	GH5_mannosidase	Domain	23	352	2.7e-53	182.0	GH family 5 beta-mannosidase-like
`XP_057794100.1`	Pfam	`PF00150`	Cellulase	Domain	89	321	3.1e-13	50.5	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938117.1
TTTCAATGGGCCTTTCTTGAAGCAAGAGAAACCACAAACCGGGTGATACGCCTTTTGACTGTCGCACAGTTCACAAATCACGGATACAAAATTAAAGGATGAAATGCTAAAAAACAACGACATGAAACGCCGTATACCATAAAGCCAGAAAACAATTTTGTGAGAAACACAAAGTGAAAAAGATGAAGAATATGTGTAGGATATTGGTGATAGTTTTGGTGATGAGTGAGGCGAGAGGCGAAGATGGATTCATGAGAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010559
ATGAAGAATATGTGTAGGATATTGGTGATAGTTTTGGTGATGAGTGAGGCGAGAGGCGAAGATGGATTCATGAGAGTTGATGGAGAGCATTTGATGCTAAACGGGAGCCCATTTTACGGAAACGGATTCAATGCATACTGGTTGATGTATGTGGCCTCCGATCCCTCTCAGCGAAGCAAAATCTCATCTGCATTTGAACAAGCTACCAATCACAGCCTCCTCATTGCAAGAACTTGGGCTTTCAGAGATGCTGGAGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794100.1
MKNMCRILVIVLVMSEARGEDGFMRVDGEHLMLNGSPFYGNGFNAYWLMYVASDPSQRSKISSAFEQATNHSLLIARTWAFRDAGDSPLQSSPGSYNQNMFQGLDYVISEAGKHNIKLILSLVDNYNYTGGKQQYVKWARNEGQNISSDDDFFTNSLVKAYYKNHIKAVLTRENTISGIAYKDDPTIMAWELMNEPRCPTDPSGNTIQAWIEEMASYVKSIDKKHLLEVGLEGFYGHKHHKKNPHFQVGTDFLRNNQIAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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