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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003922`

染色体: Chr01 坐标: 57478840-57479592 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003922`
名称	SmilChr01G003922
描述	uncharacterized SmilChr01G003922
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	57478840 - 57479592 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010566`
GeneID	`131010566`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010566`
原始查询	`LOC131010566`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=31.8; qcov=0.516; evalue=8.29e-12; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.5; qcov=0.772; evalue=3.05e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010566

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057794115.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057794115.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057794115.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057794115.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:57478871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B10,B108,B16,B71,B81,C14,C83
`Chr1:57478894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:57479061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:57479086`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B112,B30,B35,B36,B51,C12,C23,C34,C37,C49,C57
`Chr1:57479090`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B112,B30,B35,B36,B51,C12,C23,C34,C37,C49,C57
`Chr1:57479092`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B112,B30,B35,B36,B51,C12,C23,C34,C37,C49,C57
`Chr1:57479214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:57479251`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A10,A6,B112,B122,B123,B137,B139,B14,B23,B27,B34,B41,B45,B56,B57,B73,B84,B85,B93,B96,B97,C24,C28,C38,C86
`Chr1:57479275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:57479299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B38,B39,B91,C39,D6,D7
`Chr1:57479342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B91,C39,D6
`Chr1:57479405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B10,B126,B63,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794115.1

250 aa

125

250

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 57-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794115.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	57	149	2.1e-22	80.3	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938132.1
ATGGGGTGTTGGGACGAAGGAGTATGGAGGTGGAAACTCGAGTGGAGCCGAGAGCCGAGGGGTCGTGAACTTGATCAAATCCAGTCCCTTATCTCTTTCATTGACAGTTGTGTGTTGAGGACAGATAAGCGGGATGGTTGGAGATGGAAAGCGTCTTCCAATGGAGCCTTCTCCGTCAAGTCGGCTTATGAGGCTATTAGCCGGGAGAAAAGACAGCCGAACGAGCAAAGAAAAGAAGGTGAACTGACGCAGATCTGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010566
ATGGGGTGTTGGGACGAAGGAGTATGGAGGTGGAAACTCGAGTGGAGCCGAGAGCCGAGGGGTCGTGAACTTGATCAAATCCAGTCCCTTATCTCTTTCATTGACAGTTGTGTGTTGAGGACAGATAAGCGGGATGGTTGGAGATGGAAAGCGTCTTCCAATGGAGCCTTCTCCGTCAAGTCGGCTTATGAGGCTATTAGCCGGGAGAAAAGACAGCCGAACGAGCAAAGAAAAGAAGGTGAACTGACGCAGATCTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794115.1
MGCWDEGVWRWKLEWSREPRGRELDQIQSLISFIDSCVLRTDKRDGWRWKASSNGAFSVKSAYEAISREKRQPNEQRKEGELTQIWKTKAPAKAIITAWKVLKGRLPTLDNLIRRQVPIQPPIFCVFCKEKEESIDHLFFSCSKSEEVWKELIQWMGKQVVFHHKAKPHFNVFVNLGHKEDVMFLTAVWICVVWCVWKKRNECIFNQGSWIKERMVSEIKTRIWGWSLAFNLNLNTSDFCSWNATACLHG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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