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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003605`

染色体: Chr02 坐标: 57303001-57304523 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003605`
名称	SmilChr02G003605
描述	AAA-ATPase At3g50940-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	57303001 - 57304523 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010567`
GeneID	`131010567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010567`
原始查询	`LOC131010567`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AAA-ATPase At3g50940-like
产物	AAA-ATPase At3g50940-like
Arabidopsis	`AT3G50940` (AT3G50940) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824258] identity=51.8; qcov=0.97; evalue=2.52e-153; confidence=high
Rice	`Os01g0605100` - identity=47; qcov=0.965; evalue=1.44e-128; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF14363 (AAA_assoc); PF25568 (AAA_lid_At3g28540)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057794113.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057794113.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794113.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794113.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794113.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:57303187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:57303473`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C9
`Chr2:57303473`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C9
`Chr2:57303929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:57304343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794113.1

428 aa

214

428

AAA_assoc

AAA

AAA_lid_At3g28540

PF14363 AAA_assoc 40-121 aa PF00004 AAA 231-359 aa PF25568 AAA_lid_At3g28540 360-422 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794113.1`	Pfam	`PF14363`	AAA_assoc	Family	40	121	5.3e-21	75.6	Domain associated at C-terminal with AAA
`XP_057794113.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	231	359	2.1e-21	77.4	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057794113.1`	Pfam	`PF25568`	AAA_lid_At3g28540	Domain	360	422	6.3e-20	71.6	At3g28540-like, AAA+ ATPase lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938130.1
ATTCTAGATTGCTTACCCCCTCGCCAAGAAACATCTCCCTCTCTATATAACAAACTCACCATTTCAATTCAAACCACACATGGCATTTTCCTACGAATCTCTGCTGCCTGCACAGCGCATCCTGACGGCGGCAGCCTCCGCCGGCGCCTTCGCAATTCTCCTCAAATCCATCGTCAGCGACCTCATCCCCTACAAATACCTTTCCTCATCCCTGGCCAAGCTCTCGCGGCAGCTCACCGTCGTGGTCGACGAATTCGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010567
ATGGCATTTTCCTACGAATCTCTGCTGCCTGCACAGCGCATCCTGACGGCGGCAGCCTCCGCCGGCGCCTTCGCAATTCTCCTCAAATCCATCGTCAGCGACCTCATCCCCTACAAATACCTTTCCTCATCCCTGGCCAAGCTCTCGCGGCAGCTCACCGTCGTGGTCGACGAATTCGACGGCCTCACCTCCAACCAAATGTTCCACGCCGCCACCATCTACCTCGCCGCCAGAATCTCCGGCGCCACCAAGAGGATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794113.1
MAFSYESLLPAQRILTAAASAGAFAILLKSIVSDLIPYKYLSSSLAKLSRQLTVVVDEFDGLTSNQMFHAATIYLAARISGATKRIKVNKPPKQQHLAVTVDKNQEMVDVHGGIHFKWTLHSVEQSAKNESSRSEVRYLELSFNRKHRDYVLQVYLPYILEMKEETRSVRLHTVDYNGTDYWSSVVLNHPARFETMAMDPETKKGVMEDLDRFVRRKDYYRRVGKAWKRGYLLYGPPGTGKSSLVAAMANYLNFDIYDLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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