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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003607`

染色体: Chr02 坐标: 57311917-57313642 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003607`
名称	SmilChr02G003607
描述	phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	57311917 - 57313642 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010569`
GeneID	`131010569`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010569`
原始查询	`LOC131010569`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH1-like
产物	phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH1-like
Arabidopsis	`AT4G34580` (COW1) Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829610] identity=54.5; qcov=0.661; evalue=3.64e-46; confidence=medium
Rice	`Os08g0497300` (OsSNDP9) - identity=50; qcov=0.689; evalue=1.72e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010569

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057794123.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057794125.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057794123.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794125.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794125.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:57313160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B109,B24,B34,B65
`Chr2:57313176`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C26,C87
`Chr2:57313176`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C26,C87
`Chr2:57313186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794123.1

229 aa

114

229

CRAL_TRIO

PF00650 CRAL_TRIO 43-205 aa

XP_057794124.1

216 aa

108

216

CRAL_TRIO

PF00650 CRAL_TRIO 30-192 aa

XP_057794125.1

183 aa

183

CRAL_TRIO

PF00650 CRAL_TRIO 43-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794123.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	43	205	3.1e-30	105.7	CRAL/TRIO domain
`XP_057794124.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	30	192	2.6e-30	106.0	CRAL/TRIO domain
`XP_057794125.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	43	146	5.6e-09	36.7	CRAL/TRIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938141.1
CTCTTTTAACTACATAAATAAACCGAGTTGTATCCGTTACGTGCAAACACAACAAAGGCACCGCCGATATTCGGTTTTGCAGAGACGCATATTCCCGCCAAAAAGGTGAACCCCACACCCCAGCATTGCGCCACGTGGCCCGGCAGGATAATAGCCGCCAACTCCTCTTCCTTACTTGAGATTTCCTCTGTAAAACTACGCTCGATCAAAATTCTACTTTCTTCCTTTCTTTCTATCAGTATTTTGCCTTTTCGACTTCT...

XM_057938140.1
TTTAACTACATAAATAAACCGAGTTGTATCCGTTACGTGCAAACACAACAAAGGCACCGCCGATATTCGGTTTTGCAGAGACGCATATTCCCGCCAAAAAGGTGAACCCCACACCCCAGCATTGCGCCACGTGGCCCGGCAGGATAATAGCCGCCAACTCCTCTTCCTTACTTGAGATTTCCTCTGTAAAACTACGCTCGATCAAAATTCTACTTTCTTCCTTTCTTTCTATCAGTATTTTGCCTTTTCGACTTCTTTTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131010569
ATGATACAATACAATCTGCAGATTGAAAGATTCAGTCCAATGGAGAAGCCAGAAACGCTGCCTGACATCACCACCGCCACCGCCGCCGTCAAGGACTTCGATTATAAGGAGCTGTGCGAAGTGAAGCAATACTACCCCCACGGTTACCACGGTGTAGACCGATCGGGAAGGCCTGTGTACATCGAGAGATTGGGGAAGCTAGACGTGGAGGGGCTCATGAAGATCACCACACTCGAACGTTATGTCAAGTACCAAACGCA...

LOC131010569
ATGGAGAAGCCAGAAACGCTGCCTGACATCACCACCGCCACCGCCGCCGTCAAGGACTTCGATTATAAGGAGCTGTGCGAAGTGAAGCAATACTACCCCCACGGTTACCACGGTGTAGACCGATCGGGAAGGCCTGTGTACATCGAGAGATTGGGGAAGCTAGACGTGGAGGGGCTCATGAAGATCACCACACTCGAACGTTATGTCAAGTACCAAACGCAGCAGTACGAGAAGACTATCAAAATCAGGTTCCCTGCCTG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057794123.1
MIQYNLQIERFSPMEKPETLPDITTATAAVKDFDYKELCEVKQYYPHGYHGVDRSGRPVYIERLGKLDVEGLMKITTLERYVKYQTQQYEKTIKIRFPACSAAANKHVNRSIAILDVQAVSFKSFTSPVQKVLLQLRKIFNENYPETLSEMVIVNASPGFKLLWNVVKCFLDPQTVSKIQVIGSKYQSKLLELVDPSELPDFLGGSCCCMSEGGCLNSDRGPWRDTSVA

XP_057794124.1
MEKPETLPDITTATAAVKDFDYKELCEVKQYYPHGYHGVDRSGRPVYIERLGKLDVEGLMKITTLERYVKYQTQQYEKTIKIRFPACSAAANKHVNRSIAILDVQAVSFKSFTSPVQKVLLQLRKIFNENYPETLSEMVIVNASPGFKLLWNVVKCFLDPQTVSKIQVIGSKYQSKLLELVDPSELPDFLGGSCCCMSEGGCLNSDRGPWRDTSVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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