当前解析结果
SmilChr02G003617| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003617 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003617 |
| 描述 | alcohol acyltransferase 9 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 57441488 - 57445145 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131010576 |
|---|---|
| GeneID | 131010576 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010576 |
| 原始查询 | LOC131010576 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | alcohol acyltransferase 9 |
| 产物 | alcohol acyltransferase 9 |
| Arabidopsis | AT1G27620 (AT1G27620)HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839654] identity=62.3; qcov=0.949; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os01g0104900 (P0436E04.28-2)- identity=48.5; qcov=0.956; evalue=2.46e-123; confidence=high |
| GO | GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02458 (Transferase) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010576 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057794139.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057794139.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057794139.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057794139.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057794139.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:57441693 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C29,C6 |
Chr2:57441790 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B55,C22 |
Chr2:57441928 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr2:57444601 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057794139.1PF02458
Transferase 20-428 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057794139.1 |
Pfam | PF02458 |
Transferase | Family | 20 | 428 | 4.2e-70 | 237.3 | Transferase family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。