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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003637`

染色体: Chr02 坐标: 57734898-57741109 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003637`
名称	SmilChr02G003637
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	57734898 - 57741109 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010595`
GeneID	`131010595`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010595`
原始查询	`LOC131010595`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3
产物	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3
Arabidopsis	`AT4G17510` (UCH3) ubiquitin C-terminal hydrolase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827466] identity=72.7; qcov=1.02; evalue=1.13e-128; confidence=high
Rice	`Os02g0654500` - identity=64.9; qcov=0.983; evalue=1.66e-108; confidence=high
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF01088 (Peptidase_C12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010595

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794173.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794173.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057794173.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057794173.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794173.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:57735552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:57740863`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A22,A23,A25,A9,B112,B114,B124,B138,B14,B140,B23,B37,B41,B53,B67,B68,B71,B81,C1,C18,C40,C41,C45,C75,C76,D1,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794173.1

229 aa

114

229

Peptidase_C12

PF01088 Peptidase_C12 10-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794173.1`	Pfam	`PF01088`	Peptidase_C12	Domain	10	212	1.6e-69	234.7	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938190.1
TATAAAGTGGAGGCATATTTTATTTTTTATTTTCGAAAATGGGTATATATGTTTTACAAGTTACAACAATTAGATGTGTTTGTTTGTAAACTAACCACCCCAAAACCCAAAGGAAAACCAAAAACCTGAAAAGAAAAGGCACAGAAATGGCGACAACTCCTTCTACGAAGAGATGGCTTCCTCTCGAAGCAAACCCTGATGTTATGAACCAGTTTCTTTGGGGACTTGGTGTTTCCCCGGATGAGGCAGAGTGCTTTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010595
ATGGCGACAACTCCTTCTACGAAGAGATGGCTTCCTCTCGAAGCAAACCCTGATGTTATGAACCAGTTTCTTTGGGGACTTGGTGTTTCCCCGGATGAGGCAGAGTGCTTTGATGTTTATGGACTTGACGAAGAACTCTTGGCAATGGTTCCACAGCCGGTACTCGCTGTGTTGTTCCTCTACCCCATAACGCCAAAGAGTGAGGAAGAGAGGATTCAACAAGATAGTTCGACAAAGGAATCTAGTGGTGGACCTTACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794173.1
MATTPSTKRWLPLEANPDVMNQFLWGLGVSPDEAECFDVYGLDEELLAMVPQPVLAVLFLYPITPKSEEERIQQDSSTKESSGGPYFMKQTVGNACGTVGLLHAVGNVTSEIKLVEESYLDKFFKATANMDPSQRAKFLENDREMEDAHSVAATAGETEASDNVDTHFICFTCVNGQLYELDGRRAGPISHGASSSNTILQDAAKVIQKFIQKNPDSINFNVIAISKKT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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