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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003662`

染色体: Chr02 坐标: 58010046-58016971 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003662`
名称	SmilChr02G003662
描述	gamma-secretase subunit APH1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	58010046 - 58016971 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010618`
GeneID	`131010618`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010618`
原始查询	`LOC131010618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gamma-secretase subunit APH1-like
产物	gamma-secretase subunit APH1-like
Arabidopsis	`AT2G31440` (AT2G31440) gamma-secretase subunit APH1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817702] identity=70.8; qcov=1; evalue=1.05e-136; confidence=high
Rice	`Os02g0272600` (P0521F09.23-1) - identity=68.6; qcov=0.98; evalue=3.65e-120; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0016020 (membrane); GO:0016485 (protein processing); GO:0030674 (protein-macromolecule adaptor activity); GO:0043085 (positive regulation of catalytic activity); GO:0070765 (gamma-secretase complex)
KEGG	smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06105 (Aph-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010618

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057794214.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057794214.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057794214.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794214.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794214.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:58010554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:58013130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr2:58014741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B3,C29,C6,C8
`Chr2:58014781`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B74
`Chr2:58014781`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B74
`Chr2:58016676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B98,C19,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794214.1

250 aa

125

250

Aph-1

PF06105 Aph-1 5-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794214.1`	Pfam	`PF06105`	Aph-1	Family	5	238	1.1e-69	235.0	Aph-1 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938231.1
CAAACTACAATTAATTAATTATTTTATTTCCCTCCCCTTCCACAGAAACTGAGACAGTCAAAATTTTGAAGGAAACAGACATTTGATTTGATAGATCACGCAAAGCCAAGCCATATAAGTGTTGATTCAGATTGAGAGGGGAGCTTAATACGGCGGAGGAAGATGACGGTGGCGGCGGGGATCGGCTACGCGTTGCTAGCACTGGGCCCCTCTCTCTCACTCTTCGTCGCCGTTATTTCCCGCAAGCCCTTTCTCACTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010618
ATGACGGTGGCGGCGGGGATCGGCTACGCGTTGCTAGCACTGGGCCCCTCTCTCTCACTCTTCGTCGCCGTTATTTCCCGCAAGCCCTTTCTCACTCTAACTCTTCTCTCCAGTACATTGGTATGGCTGATGAGTCTCATTGCATTATCGGCAGTCTGGAGAGCGTTTCTCCCGTTCAAAACGGCGACGTGGTGGCCTTATTCGCTGCTAATTCTTACTTCCGTTGCCCTCCAAGAAGCTCTCCGGATTTTCTTGTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794214.1
MTVAAGIGYALLALGPSLSLFVAVISRKPFLTLTLLSSTLVWLMSLIALSAVWRAFLPFKTATWWPYSLLILTSVALQEALRIFLWKVNKRMEEMLDAYADRVSKPRLYITDKMQISLAGGMGHGVAHAVFFCISLLTPAFGPATYYVEKCSKIPFFLVSAIMALAFVTIHTFSMVIAFNGYSEGNKKDQYFAPVVHLAAGVFTLINLASGGCVVGIPLLYVLAIVTLIHCGNTVWRRLTDNQSRATNLQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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