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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003663`

染色体: Chr02 坐标: 58020807-58022294 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003663`
名称	SmilChr02G003663
描述	homoserine kinase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	58020807 - 58022294 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010619`
GeneID	`131010619`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010619`
原始查询	`LOC131010619`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homoserine kinase-like
产物	homoserine kinase-like
Arabidopsis	`AT2G17265` (HSK) homoserine kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816232] identity=76.8; qcov=0.874; evalue=7.31e-162; confidence=high
Rice	`Os02g0831800` - identity=62.5; qcov=0.885; evalue=1.7e-113; confidence=high
GO	GO:0004413 (homoserine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006566 (L-threonine metabolic process)
KEGG	smil00260 (Glycine, serine and threonine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00288 (GHMP_kinases_N); PF08544 (GHMP_kinases_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010619

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057794215.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057794215.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794215.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794215.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794215.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:58020969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B103,B82,C19,D7
`Chr2:58021128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:58021129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C87,D2
`Chr2:58021166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,A23,B20,B65
`Chr2:58021225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C6
`Chr2:58021229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr2:58021560`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B12
`Chr2:58021560`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B12
`Chr2:58021562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr2:58021744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:58021766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B58,C27,C63
`Chr2:58021921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794215.1

374 aa

187

374

GHMP_kinases_N

GHMP_kinases_C

PF00288 GHMP_kinases_N 127-206 aa PF08544 GHMP_kinases_C 270-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794215.1`	Pfam	`PF00288`	GHMP_kinases_N	Domain	127	206	1.4e-16	61.2	GHMP kinases N terminal domain
`XP_057794215.1`	Pfam	`PF08544`	GHMP_kinases_C	Domain	270	345	1.2e-10	42.3	GHMP kinases C terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938232.1
AAAAAAAACACATCCGCTTATATGAGCGCCGCCGCCACTCTCCCCTAACTCACTGTCACGGCGCTTAAACCCGACCCGTTACATAAAAGAGAGCCTTTTCACCCCGCCGCTACTCTCCAACTCTCTCACTCACAATGGCCACCGTATGCCTGAAGCTCACAACCATCTCCGCCACCGCCACCGCCACTACCGCCAACACATCACCATCAAAATCCCCAACCCAATTAAGATTCAACACATCCACATCCGCACTACCCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010619
ATGGCCACCGTATGCCTGAAGCTCACAACCATCTCCGCCACCGCCACCGCCACTACCGCCAACACATCACCATCAAAATCCCCAACCCAATTAAGATTCAACACATCCACATCCGCACTACCCTCCTCCACCTACACCAAATCTACCGAGCCTCTCCCCGTCTTCTCCGCCGTCAAATCCTTCGCCCCCGCCACAGTCGCCAACTTGGGTCCCGGCTTCGACTTCCTGGGCTGCGCCGTCGATGGAATCGGCGACTACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794215.1
MATVCLKLTTISATATATTANTSPSKSPTQLRFNTSTSALPSSTYTKSTEPLPVFSAVKSFAPATVANLGPGFDFLGCAVDGIGDYVSLRVDPDVPLGEVSISHISGAGSRLSKNPLWNCAGIAAIAVMKMLSIRSVGLSLSLEKGLPLGSGLGSSAASAAAAAVAVNELFGGPLSSSELVIAGLESEAKVSGYHADNVAPSILGGFVLIRSYEPLELMQLKFPQEKSLYFVLVNPEFEAPTKKMRAALPPEVSMSNHVW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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