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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003714`

染色体: Chr02 坐标: 58741135-58743443 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003714`
名称	SmilChr02G003714
描述	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	58741135 - 58743443 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010667`
GeneID	`131010667`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010667`
原始查询	`LOC131010667`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
产物	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
Arabidopsis	`AT1G58470` (RBP1) RNA-binding protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842216] identity=45.9; qcov=0.782; evalue=1.44e-71; confidence=high
Rice	`Os10g0470900` (RBPJ) - identity=51.9; qcov=0.555; evalue=2.19e-69; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF16367 (RRM_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010667

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794286.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057794286.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057794286.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057794286.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057794286.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:58741645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:58741701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr2:58741783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:58741927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C87,D2
`Chr2:58742014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:58742192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:58743001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr2:58743024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:58743032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:58743095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794286.1

371 aa

186

371

RRM_7

RRM_1

RRM_7

RRM_1

PF16367 RRM_7 7-71 aa PF00076 RRM_1 9-75 aa PF16367 RRM_7 115-180 aa PF00076 RRM_1 117-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794286.1`	Pfam	`PF16367`	RRM_7	Domain	7	71	1.8e-15	57.4	RNA recognition motif
`XP_057794286.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	9	75	3.9e-34	117.1	RNA recognition motif
`XP_057794286.1`	Pfam	`PF16367`	RRM_7	Domain	115	180	1.8e-15	57.4	RNA recognition motif
`XP_057794286.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	117	184	3.9e-34	117.1	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938303.1
ATTAGATTCCTACACAATCTCTCTCCTACGTGTTGCCCCTCAAATACACCACCAATCCAGATTCACTCTCCTCACTTTTGGGACCCCTTTTTTCTCTCTCATACTTAAACAACCTTTCTCTCTCCTCCCTCTCACCCCCTTTTCCCTCTCTCTTTCCCCCCAATTTTTTCCTTCGCACTCCACCCCAAAAAAAACCCTAGTTTTCTCCCCCCTCCCGAGCTGTCGTTTCGCCTCTTCCGAATTCCCCCGCCCCCTCCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010667
ATGGACGATTCGGAGCAGAACAAGCTGTTTGTTGGGGGCATTTCGTGGGACACGACGGACGATGTGCTCAAGGACCATTTTTGCAAGTACGGCGACGTTTTGGGCTCCGTGATTGCTCGGGATCGGAATTCCGGTCACCCCAGGGGCTTCGCTTTCGTCACCTTCTCGGAATCTTCGGCCGTCGACCGCGCTCTCCAGGATTCCCATCAAATTCTTAGCAGAACGGTGGAAGTGAAAAGGGCCATTCCTAGGAGCGAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794286.1
MDDSEQNKLFVGGISWDTTDDVLKDHFCKYGDVLGSVIARDRNSGHPRGFAFVTFSESSAVDRALQDSHQILSRTVEVKRAIPRSEQQSQQQNNRGSSRNNSRTNSRSNDQFRTKKIFVGGLSANLTEEEFRSYFEKFGRITDVVVMHDNLTHRPRGFGFITFDSEDSVEEVMQKNFHELTGKLVEVKRAVPKDGIGSSNIGYNGRLGGGRSPTSFNSYQQGSYTPFNSRYGYFPGYGNVAGYPYGAGIFGGGYPSGGYS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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