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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003748`

染色体: Chr02 坐标: 59130392-59133992 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003748`
名称	SmilChr02G003748
描述	protein NPGR1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	59130392 - 59133992 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010682`
GeneID	`131010682`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010682`
原始查询	`LOC131010682`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NPGR1
产物	protein NPGR1
Arabidopsis	`AT1G27460` (NPGR1) no pollen germination related 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839637] identity=58.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0200600` - identity=50; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13432 (TPR_16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010682

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794323.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057794323.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057794323.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794323.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794323.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:59130571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,D11
`Chr2:59130607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:59130611`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C19
`Chr2:59130611`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C19
`Chr2:59130628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:59130693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr2:59130736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B120
`Chr2:59130778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B20,B34,C79
`Chr2:59130781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B40,B47,C16,C76
`Chr2:59130784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C72
`Chr2:59131107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B56,B96,C31
`Chr2:59131113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794323.1

710 aa

355

710

TPR_16

PF13432 TPR_16 46-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794323.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	46	92	3.1e-12	47.4	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938340.1
AAGGGGCAGTATTATTAGAAATAATGAGTTGCAAGGTCAATTTAAAATAAGTTTGGAGAAGACATCAAGATTTGAGAAAACCTCAAAAAACAAAAAATGAAGAGATTTGTGAGTAATAGAGAGAATCTTAAGACAGCAGGTGCCTAGTGTGGAACAACCCACCACTGCAAAAGCCTCTCTGTATTGTCACTCAAAACTACCCATAACTCTTACTACCAAACAAAAACATTGTCTTTTGCAACAACGATATTTCAAAGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010682
ATGTTGTGCGCGTGTTCCGGAGAGCAATTCAAGCTCGAAGAGGCAATCCCGCAGTCTCCTGAATCACTGGCCACGAGGGATTTTTCTGCCAGTGGCATCTCATCGAGAACTGGAAATGGTGATTGGGAATCCAAGCTCGAAGATGCTCAAGTTGATGAAGCCGAGTCCACGTTGAAGGAGGCACTTTCTCTGAATTACGAGGAAGCTAGAGCGTTGCTGGGAAGACTTGAATACCAAAGAGGCAATTTTGATGCTGCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794323.1
MLCACSGEQFKLEEAIPQSPESLATRDFSASGISSRTGNGDWESKLEDAQVDEAESTLKEALSLNYEEARALLGRLEYQRGNFDAALQVFQGIDIRLLSPRMSKAITERTRPRKSRSSRGRSVLTGVMSLHSVSLLLEAMLLKANSLAELGRVKEAARECKIILDTVESALPHGIYGEVNGDSKLLEMFHRALELLPKLWLQAGSLDEAIAAYRRALLRPWNLDPQRLAKVQKDLAATLLYGGVEASIPSEFKPIGATFP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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