当前解析结果
SmilChr02G003767| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003767 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003767 |
| 描述 | QWRF motif-containing protein 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 59368358 - 59373370 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131010683 |
|---|---|
| GeneID | 131010683 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010683 |
| 原始查询 | LOC131010683 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | QWRF motif-containing protein 2-like |
| 产物 | QWRF motif-containing protein 2-like |
| Arabidopsis | AT1G49890 (QWRF2)QWRF motif protein (DUF566) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841412] identity=42.1; qcov=1.09; evalue=3.24e-120; confidence=medium |
| Rice | Os03g0762900- identity=35; qcov=0.821; evalue=9.12e-61; confidence=medium |
| GO | GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005813 (centrosome); GO:0005880 (nuclear microtubule); GO:0007098 (centrosome cycle); GO:0008017 (microtubule binding); GO:0051225 (spindle assembly) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04484 (QWRF) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010683 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 1.00000 | XP_057794324.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057794324.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057794324.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057794324.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057794324.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:59372090 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr2:59372454 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:59372573 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B65 |
Chr2:59372628 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr2:59372756 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr2:59372877 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr2:59372946 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057794324.1PF04484
QWRF 273-577 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057794324.1 |
Pfam | PF04484 |
QWRF | Family | 273 | 577 | 6.9e-96 | 322.2 | QWRF family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。