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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003726`

染色体: Chr02 坐标: 58886403-58891272 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003726`
名称	SmilChr02G003726
描述	histone deacetylase 19
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	58886403 - 58891272 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010686`
GeneID	`131010686`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010686`
原始查询	`LOC131010686`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone deacetylase 19
产物	histone deacetylase 19
Arabidopsis	`AT4G38130` (HD1) histone deacetylase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829969] identity=87.9; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0583400` (HDAC1) - identity=80.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004407 (histone deacetylase activity); GO:0016575 (GO:0016575)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00850 (Hist_deacetyl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010686

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794327.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057794327.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794327.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057794327.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057794327.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:58886750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:58887333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:58889066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,C17,C44,C77,D9
`Chr2:58889318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:58890383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794327.1

464 aa

232

464

Hist_deacetyl

PF00850 Hist_deacetyl 36-324 aa

XP_057794328.1

464 aa

232

464

Hist_deacetyl

PF00850 Hist_deacetyl 36-324 aa

XP_057794329.1

464 aa

232

464

Hist_deacetyl

PF00850 Hist_deacetyl 36-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794327.1`	Pfam	`PF00850`	Hist_deacetyl	Domain	36	324	4.1e-88	296.3	Histone deacetylase domain
`XP_057794328.1`	Pfam	`PF00850`	Hist_deacetyl	Domain	36	324	4.1e-88	296.3	Histone deacetylase domain
`XP_057794329.1`	Pfam	`PF00850`	Hist_deacetyl	Domain	36	324	4.1e-88	296.3	Histone deacetylase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938344.1
AAAAAAGAAAAAGAAAAGAAATAAATGAATAATTAATTAATAAATACCTAACGCCGAAATCCCGTTTAGCTTTGTATCGGAAGCTCGGCCGCTTAAATTCATATTCAACTTCCAACCTTCTTCACCTCTTCGTTGTTGTTTCGGTGATTAAAAGTAACCTATTTCTCAGTGGTGAATGGATACCGGAGGCAATTCTTTAGCATCTGGAGCCGATGGGGTCAAGCGGAAAGTAAGCTATTTCTATGACCCAGAGGTCGGGA...

XM_057938346.1
AAGAAAAGAAATAAATGAATAATTAATTAATAAATACCTAACGCCGAAATCCCGTTTAGCTTTGTATCGGAAGCTCGGCCGCTTAAATTCATATTCAACTTCCAACCTTCTTCACCTCTTCGTGGTGAATGGATACCGGAGGCAATTCTTTAGCATCTGGAGCCGATGGGGTCAAGCGGAAAGTAAGCTATTTCTATGACCCAGAGGTCGGGAATTATTACTATGGGCAAGGTCACCCGATGAAGCCGCACAGGATTCGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131010686
ATGGATACCGGAGGCAATTCTTTAGCATCTGGAGCCGATGGGGTCAAGCGGAAAGTAAGCTATTTCTATGACCCAGAGGTCGGGAATTATTACTATGGGCAAGGTCACCCGATGAAGCCGCACAGGATTCGCATGACGCACTTCCTTCTTGCACATTATGGATTGTTGCAGCATATGCACGTTCTCAAGCCGAATCCCGCTAGGGACAAAGATCTCTGCAGATTTCATGCCGATGATTATGTTTCTTTTCTGAGGAGCAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057794327.1
MDTGGNSLASGADGVKRKVSYFYDPEVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHFLLAHYGLLQHMHVLKPNPARDKDLCRFHADDYVSFLRSITPETQQEQLRQLKRFNVGEDCPVFDGLYSFCQTYAGGSVGGAVKLNHGHCDIAVNWAGGLHHAKKCEASGFCYVNDIVLAILELLKVHERVLYVDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKFGDYFPGTGDVRDIGYGKGKYYSLNVPLDDGIDDESYQSLFKPIMGKVMEIF...

XP_057794328.1
MDTGGNSLASGADGVKRKVSYFYDPEVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHFLLAHYGLLQHMHVLKPNPARDKDLCRFHADDYVSFLRSITPETQQEQLRQLKRFNVGEDCPVFDGLYSFCQTYAGGSVGGAVKLNHGHCDIAVNWAGGLHHAKKCEASGFCYVNDIVLAILELLKVHERVLYVDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKFGDYFPGTGDVRDIGYGKGKYYSLNVPLDDGIDDESYQSLFKPIMGKVMEIF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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