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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003733`

染色体: Chr02 坐标: 58964002-58969077 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003733`
名称	SmilChr02G003733
描述	uncharacterized SmilChr02G003733
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	58964002 - 58969077 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010687`
GeneID	`131010687`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010687`
原始查询	`LOC131010687`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837615]; symbol=AT1G10720; hit=AT1G10720; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837615]; symbol=AT1G10720; hit=AT1G10720; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G10720` (AT1G10720) BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837615] identity=39.6; qcov=0.852; evalue=2.19e-59; confidence=medium
Rice	`Os05g0510700` - identity=36.7; qcov=0.802; evalue=2.17e-48; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03909 (BSD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010687

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057794330.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057794330.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057794330.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057794330.1`
5	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057794330.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:58964518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B131,B50,B78,C23
`Chr2:58964576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:58964580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B56
`Chr2:58964802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B135,B136,B55,C86
`Chr2:58966077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B32,C45,C67,D11
`Chr2:58966196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B18,B24,B33,C48
`Chr2:58968486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794330.1

459 aa

230

459

BSD

PF03909 BSD 213-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794330.1`	Pfam	`PF03909`	BSD	Domain	213	268	2e-11	44.4	BSD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938347.1
ATATTTTAAAAAATAAAAGAATATAAAAACATTAAGGTCCACGTCAGCAGCGTAAAGCGGAGAAGACAAAATAATCATCACGAAAGAAACATTATCGTTCTTTCACCTTGTGCGAAAAAAAGCAAACAATTTTGAAATTCAAGGTCGATATCTCCACCAAACGACGTCGTAGGAACATGTCTTGGCTGGCTCGCTCCATCGCCGACAGTCTCCGCCTCGATGATGAAGAAGAAGATGCAACGGCGGCGGCGGCGGTGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010687
ATGTCTTGGCTGGCTCGCTCCATCGCCGACAGTCTCCGCCTCGATGATGAAGAAGAAGATGCAACGGCGGCGGCGGCGGTGGAGGAGGCCATGAAGCCCGTAGAAGACTCCGTTCCACGACCCACTGCAAACGACACCATGCTCCAGGAGGATCACCCTCGCGACTCCGCGTTCTCAATCGAAGATCGCCGATCGGATAGTGATGGCGGCGCCAGTGGTAATCACGGTGTCGACGAAGATGTTGAAGGCGATTACGATCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794330.1
MSWLARSIADSLRLDDEEEDATAAAAVEEAMKPVEDSVPRPTANDTMLQEDHPRDSAFSIEDRRSDSDGGASGNHGVDEDVEGDYDRRGVKEDLSEFRESLTRQFWGVASFLAPPPPPPPPPPLFNRSSIQLESDLAGSVNADEEGEEELLEYDERESGQSGESANSSQSKDDDEDTLEDAVGITEEVLAFARNIAHHPETWLDFPIEEEEFDDFDISEAQYKHALAIEHLAPRLAALRFELCPVHMGVGYFWMVYFVLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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