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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003734`

染色体: Chr02 坐标: 58971007-58973489 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003734`
名称	SmilChr02G003734
描述	lecithin-cholesterol acyltransferase-like 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	58971007 - 58973489 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010690`
GeneID	`131010690`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010690`
原始查询	`LOC131010690`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lecithin-cholesterol acyltransferase-like 1
产物	lecithin-cholesterol acyltransferase-like 1
Arabidopsis	`AT1G27480` (AT1G27480) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839639] identity=58; qcov=0.998; evalue=4.1e-180; confidence=high
Rice	`Os03g0730000` - identity=59.4; qcov=0.919; evalue=8.78e-162; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008374 (GO:0008374)
KEGG	-
Pfam	PF02450 (LCAT); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010690

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057794334.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057794334.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794334.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794334.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794334.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:58971367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr2:58971396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr2:58971580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B15,B84,B89
`Chr2:58971652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B124,B53,B71,D3
`Chr2:58971688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B64,D9
`Chr2:58971711`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A10,C39
`Chr2:58971711`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A10,C39
`Chr2:58973116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794334.1

434 aa

217

434

LCAT

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

LCAT

PF02450 LCAT 72-307 aa PF12146 Hydrolase_4 177-236 aa PF12697 Abhydrolase_6 177-325 aa PF02450 LCAT 323-407 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794334.1`	Pfam	`PF02450`	LCAT	Family	72	307	1.7e-45	156.7	Lecithin:cholesterol acyltransferase
`XP_057794334.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	177	236	2e-06	28.0	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057794334.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	177	325	7.3e-06	27.5	Alpha/beta hydrolase family
`XP_057794334.1`	Pfam	`PF02450`	LCAT	Family	323	407	1.7e-45	156.7	Lecithin:cholesterol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938351.1
CTTTAGTACCTCACTACACACAGACAAAAAGCATGAGCTCCCATAATTCACATTCAAAAGTGGCCGTATTTTCATTGGCCATGGTGTTATACACCTGGTGCAGAGCATCATCGGCGCTGCACCCGGTGGTGTTAATACCGGGAGCCGGCGGCAACCAGCTGGAAGCCCGGCTGACGGGCACGTACAAGCCGTCAAGCCTGCTGTGCAACCGGTGGTATCCGTTGAACAAGGACCCGGATGGGTGGTTCAGGATCTGGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010690
ATGAGCTCCCATAATTCACATTCAAAAGTGGCCGTATTTTCATTGGCCATGGTGTTATACACCTGGTGCAGAGCATCATCGGCGCTGCACCCGGTGGTGTTAATACCGGGAGCCGGCGGCAACCAGCTGGAAGCCCGGCTGACGGGCACGTACAAGCCGTCAAGCCTGCTGTGCAACCGGTGGTATCCGTTGAACAAGGACCCGGATGGGTGGTTCAGGATCTGGTTCGACCCGAGTGTGCTGCTCCGACCCTTCACCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794334.1
MSSHNSHSKVAVFSLAMVLYTWCRASSALHPVVLIPGAGGNQLEARLTGTYKPSSLLCNRWYPLNKDPDGWFRIWFDPSVLLRPFTKCFSERMKIYYDPHLDDYHNAPGVETRVPSFGSTDSLLYLDPNLKYITSYMESLVRSLEEIGYVSGQNLFGAPYDFRYGLAAQGHPCNVGSEFLDNLKTLIESASDSNGGKPVILVSHSLGGLFALHLLDRAPASWRHRVKHLISLSAPWGGTVEEMLTFASGTTLGVPLVDPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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