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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003749`

染色体: Chr02 坐标: 59140148-59142089 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003749`
名称	SmilChr02G003749
描述	60S ribosomal protein L15-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	59140148 - 59142089 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010708`
GeneID	`131010708`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010708`
原始查询	`LOC131010708`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L15-like
产物	60S ribosomal protein L15-like
Arabidopsis	`AT4G16720` (AT4G16720) Ribosomal protein L23/L15e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827375] identity=85.3; qcov=1; evalue=2.32e-120; confidence=high
Rice	`Os03g0598800` (OsRPL15) - identity=86.8; qcov=1; evalue=3.56e-122; confidence=high
GO	GO:0002181 (cytoplasmic translation); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00827 (Ribosomal_L15e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010708

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794356.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057794356.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794356.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794356.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:59141725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,B81,C21,C7
`Chr2:59141764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A11,A4,A9,B102,B109,B111,B34,B4,B55,B77,B78,B95,C12,C17,C19,C20,C31,C45,C5,C72,C74,D1,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794356.1

204 aa

102

204

Ribosomal_L15e

PF00827 Ribosomal_L15e 2-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794356.1`	Pfam	`PF00827`	Ribosomal_L15e	Family	2	190	5.1e-92	307.5	Ribosomal L15

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938373.1
CAAAAATCAATTTTACAATATTAGCCCATATTGGCCCACTATAAAGGCCCAAGTAACTGATCTAAAACCCTAGCTCTCTCCCATATGCCATATAATCTCTCGCGCTTCTCTCCCCATCTCTCAGAGTGCAGCGGCGACAACCATGGGTGCTTACACGTATGTGTCGGAGCTATGGAAGAAGAAGCAATCCGATGTGATGCGGTTCCTGCTTAGGGTTCGATGCTGGGAGTATCGCCAGCTTCCTGCTGTTGTACGCGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010708
ATGGGTGCTTACACGTATGTGTCGGAGCTATGGAAGAAGAAGCAATCCGATGTGATGCGGTTCCTGCTTAGGGTTCGATGCTGGGAGTATCGCCAGCTTCCTGCTGTTGTACGCGTCACTCGCCCGACCCGCCCCGACAAGGCCCGCCGCCTCGGCTACAAGGCCAAGCAGGGATATGTGATTTACCGAGTTCGTATCAGAAGAGGTGGAAGGAAGAGGCCAGTCTCCAAGGGTATTGTGTATGGCAAGCCCACCAACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794356.1
MGAYTYVSELWKKKQSDVMRFLLRVRCWEYRQLPAVVRVTRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRVRIRRGGRKRPVSKGIVYGKPTNQGVTQLKFQRSKRSVAEERAGRKLGGLRVLSSYWINEDSTYKYFEVILIDPAHTTIRNDPRINWICNPVHKHRELRGLTSAGKKYRGLRGRGHLHHKARPSRRATWKRNQTLSLRRYR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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