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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003783`

染色体: Chr02 坐标: 59497781-59501962 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003783`
名称	SmilChr02G003783
描述	pumilio homolog 12-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	59497781 - 59501962 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010728`
GeneID	`131010728`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010728`
原始查询	`LOC131010728`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pumilio homolog 12-like
产物	pumilio homolog 12-like
Arabidopsis	`AT5G56510` (PUM12) pumilio 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835752] identity=36.4; qcov=0.616; evalue=3.47e-64; confidence=medium
Rice	`Os11g0579900` - identity=37.1; qcov=0.605; evalue=5.02e-65; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0010608 (post-transcriptional regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF00806 (PUF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010728

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794373.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057794373.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057794373.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794373.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794373.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:59499331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,C64,C66,D5
`Chr2:59499366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr2:59499558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:59501099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,C75
`Chr2:59501244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:59501553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B46,B77,C36
`Chr2:59501574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794373.1

526 aa

263

526

PUF

PF00806 PUF 253-283 aa PF00806 PUF 290-316 aa PF00806 PUF 327-356 aa PF00806 PUF 359-393 aa PF00806 PUF 395-413 aa PF00806 PUF 432-452 aa PF00806 PUF 474-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794373.1`	Pfam	`PF00806`	PUF	Repeat	253	283	3.2e-37	126.4	Pumilio-family RNA binding repeat
`XP_057794373.1`	Pfam	`PF00806`	PUF	Repeat	290	316	3.2e-37	126.4	Pumilio-family RNA binding repeat
`XP_057794373.1`	Pfam	`PF00806`	PUF	Repeat	327	356	3.2e-37	126.4	Pumilio-family RNA binding repeat
`XP_057794373.1`	Pfam	`PF00806`	PUF	Repeat	359	393	3.2e-37	126.4	Pumilio-family RNA binding repeat
`XP_057794373.1`	Pfam	`PF00806`	PUF	Repeat	395	413	3.2e-37	126.4	Pumilio-family RNA binding repeat
`XP_057794373.1`	Pfam	`PF00806`	PUF	Repeat	432	452	3.2e-37	126.4	Pumilio-family RNA binding repeat
`XP_057794373.1`	Pfam	`PF00806`	PUF	Repeat	474	487	3.2e-37	126.4	Pumilio-family RNA binding repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938390.1
CACAAAATACTCATTAAACTAAGGAAGTTCCAAAAGAAATCGAAGCAGAAGAAGATAGATGTATATATAAAAAAAAATGAAAAAAATAGAGAGAAGGTAAAAGGAGTGTCCGTCCCTCCCCTATAAATAAAACCCCTGAGTAAACCCCTCCCTACAAAATCTTCAACCCAAAAACACACACACACACTCGCAAAACGGCGATGGAGCCACATATCTTTGAAAATCTATGCTCTTCGCCCTTCCAACCGCCTGAGGATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010728
ATGGAGCCACATATCTTTGAAAATCTATGCTCTTCGCCCTTCCAACCGCCTGAGGATTTCTTCACCCCGGAGGCGTACCGCTTTTTCCCCGCCGCAAACCATCGCCAAACCCCTCTGATCACCGAGTCCGACCAAACAATCGAATCAGCCTTTTCCAGGCTCAACCTCGCCACCAATGTCCGATTCCGGTCCCAGGAGGCGTCGTTCCACGGCCATCCCGCCGCCGTCGACGTAGGCGGAGCAGCATCAATTCCGCCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794373.1
MEPHIFENLCSSPFQPPEDFFTPEAYRFFPAANHRQTPLITESDQTIESAFSRLNLATNVRFRSQEASFHGHPAAVDVGGAASIPPPMAYGGSQQQQALNWAQTSSVNGPLGLPGARQNINVGSSFSGGGPYVHAGGHIHNQLINCYQRLDFCDANNSDDFDYHILHGKESRRYNVPVVPLARKNNSFANSLYTDQQLYKLAHHLTIENMIGKIVSLAKDLVWSSVLILKLEVGMSDNEIEMIVLEVMESCDDLLRNQFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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