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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr02G003796

染色体: Chr02 坐标: 59604815-59607390 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr02G003796
名称SmilChr02G003796
描述uncharacterized SmilChr02G003796
染色体 / SeqIDChr02 / NC_080388.1
坐标与链方向59604815 - 59607390 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131010741
GeneID131010741
locus_tag-
NCBI NameLOC131010741
原始查询LOC131010741

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述Glycosyl hydrolase family 35 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831885]; symbol=AT5G01075; hit=AT5G01075; species=arabidopsis; confidence=low
产物Glycosyl hydrolase family 35 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831885]; symbol=AT5G01075; hit=AT5G01075; species=arabidopsis; confidence=low
ArabidopsisAT5G01075 (AT5G01075)
Glycosyl hydrolase family 35 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831885]
identity=65; qcov=0.348; evalue=8.24e-12; confidence=low
RiceOs03g0206201
-
identity=59.4; qcov=0.278; evalue=6.29e-09; confidence=weak
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131010741

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Secreted 分泌到胞外 1.00000 XP_057794386.1
2 Cell membrane 细胞膜 0.20000 XP_057794386.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057794386.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057794386.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057794386.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr2:59605195 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A24,A5,B42,C64,D10
Chr2:59606923 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 A21,C31,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA
XM_057938403.1
ACCAATCTTGACAGAAGGCGCGCATTCCACCGCTCTCGCAAGCATTCACTCACACATTTATACCTCTCTGCAACTTCTGCAGAAAAATTAAAAAAAATTAAATCCTACGGCCAGGCCAAATGCAACGGCTGTGACAACGAAAACCCACATGATCATTTATCATGATTCATCACCGCAAGACGACATTCTGATTTTATTTCGCTTCCAATTTTTGTTGTTGTGTTATTTAATTTTAGGGTATGGGCAGAGATCGCTGTTTC...
XM_057938404.1
ATCTTGACAGAAGGCGCGCATTCCACCGCTCTCGCAAGCATTCACTCACACATTTATACCTCTCTGCAACTTCTGCAGAAAAATTAAAAAAAATTAAATCCTACGGCCAGGCCAAATGCAACGGCTGTGACAACGAAAACCCACATGATCATTTATCATGATTCATCACCGCAAGACGACATTCTGATTTTATTTCGCTTCCAATTTTTGTTGTTGTGTTATTTAATTTTAGGGTATGGGCAGAGATCGCTGTTTCTCCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA
LOC131010741
ATGAGGGGTTTTGGATTCTTGTGTTTGTTCATGTTGATTGGGACAGCTGCTTTCGTTTACCACGGCTATTCTAGTAAAGGAAGATTCAGCTCAAATCCAGGTATGGTTTCAACAGCGAGCAATGCTATGACATTGGTACTGAAAAGCAGGAGGCTTAAGGAGAATAGGTATCCTCCTACACCACACAGAGACGAAGCTCATATTAATTTGGAAGATTACCGGCCCATCGATCCAGTTCCAAATTCGAAGGCTTCAATAAG...
LOC131010741
ATGAGGGGTTTTGGATTCTTGTGTTTGTTCATGTTGATTGGGACAGCTGCTTTCGTTTACCACGGCTATTCTAGTAAAGGAAGATTCAGCTCAAATCCAGCTGGTTTCATGTACCATGGTTATTCTAGTGCAGGAAGCTTAATCTCAAATCCAGCGAGCAATGCTATGACATTGGTACTGAAAAGCAGGAGGCTTAAGGAGAATAGGTATCCTCCTACACCACACAGAGACGAAGCTCATATTAATTTGGAAGATTACCG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA
XP_057794386.1
MRGFGFLCLFMLIGTAAFVYHGYSSKGRFSSNPAGFMYHGYSSAGSLISNPGMVSTASNAMTLVLKSRRLKENRYPPTPHRDEAHINLEDYRPIDPVPNSKASIRPGPIQHGTPLMPYIPNPSPTPGKPQHGG
XP_057794387.1
MRGFGFLCLFMLIGTAAFVYHGYSSKGRFSSNPAGFMYHGYSSAGSLISNPASNAMTLVLKSRRLKENRYPPTPHRDEAHINLEDYRPIDPVPNSKASIRPGPIQHGTPLMPYIPNPSPTPGKPQHGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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