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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004046`

染色体: Chr01 坐标: 58898460-58898936 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004046`
名称	SmilChr01G004046
描述	uncharacterized SmilChr01G004046
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58898460 - 58898936 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010764`
GeneID	`131010764`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010764`
原始查询	`LOC131010764`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008106]; symbol=AT3G63095; hit=AT3G63095; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008106]; symbol=AT3G63095; hit=AT3G63095; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G63095` (AT3G63095) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008106] identity=56.9; qcov=0.367; evalue=1.21e-19; confidence=low
Rice	`Os07g0655800` (OS-RP2) - identity=52.9; qcov=0.323; evalue=7.55e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010764

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057794416.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057794416.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794416.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794416.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794416.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58898531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr1:58898568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:58898575`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B138,B5,C24
`Chr1:58898575`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B138,B5,C24
`Chr1:58898576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B126,B57,B63,C43
`Chr1:58898633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:58898640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:58898652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B53,C39
`Chr1:58898653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B37
`Chr1:58898658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C25
`Chr1:58898661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:58898748`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938433.1
ATGGCCCTCAAATTAGAAGCAGCCGCCATTCTGATCCTCACCCTCTGGCTCTACCCCACCACCCCACAAGCCCAATGGCTCCCCCACCTGCCGCCGCCGCATCCGCTGCCACTGCCGCTACCGCTGCCGGATTCTCCAAGGCCACTCTGCGTATCCCAGCTCGCATTGGTGAACCGCGCGTGCGGACGTCTGCCGTATGCACGAGTCCCTCCACCGTCCCCACCGTCCCCGCCGTCGCCTCCCGCCGGCGAAGGCGGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010764
ATGGCCCTCAAATTAGAAGCAGCCGCCATTCTGATCCTCACCCTCTGGCTCTACCCCACCACCCCACAAGCCCAATGGCTCCCCCACCTGCCGCCGCCGCATCCGCTGCCACTGCCGCTACCGCTGCCGGATTCTCCAAGGCCACTCTGCGTATCCCAGCTCGCATTGGTGAACCGCGCGTGCGGACGTCTGCCGTATGCACGAGTCCCTCCACCGTCCCCACCGTCCCCGCCGTCGCCTCCCGCCGGCGAAGGCGGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794416.1
MALKLEAAAILILTLWLYPTTPQAQWLPHLPPPHPLPLPLPLPDSPRPLCVSQLALVNRACGRLPYARVPPPSPPSPPSPPAGEGGHHHHHAARREGYVETAAEEECCRWLKEVDTVCVCDLLVHLPPFMTRPVHEYKVVVDDSCEVSFGCASRLVKF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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