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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003828`

染色体: Chr02 坐标: 59940962-59943265 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003828`
名称	SmilChr02G003828
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 8.2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	59940962 - 59943265 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010770`
GeneID	`131010770`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010770`
原始查询	`LOC131010770`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 8.2-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 8.2-like
Arabidopsis	`AT3G54140` (PTR1) peptide transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824581] identity=47.1; qcov=0.937; evalue=1.32e-178; confidence=high
Rice	`Os03g0719900` (OsPTR8) - identity=44.9; qcov=0.952; evalue=8.81e-178; confidence=medium
GO	GO:0006857 (oligopeptide transport); GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00854 (PTR2); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010770

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057794419.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794419.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794419.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794419.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794419.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:59941172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B132,C60
`Chr2:59941462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:59941948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B60,B79,C27
`Chr2:59941973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B135,B49,C58
`Chr2:59942055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B69
`Chr2:59942312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B69
`Chr2:59942371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:59942687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr2:59942783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C42
`Chr2:59942879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C18,C39
`Chr2:59942894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:59943052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794419.1

601 aa

300

601

MFS_1

PTR2

PF07690 MFS_1 64-505 aa PF00854 PTR2 117-528 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794419.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	64	505	4.1e-12	46.4	Major Facilitator Superfamily
`XP_057794419.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	117	528	1.6e-101	340.8	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938436.1
CATACACATACATCACACAGTAGCTCATCATCTTCATGGAAATTACAACCGTAAAACAGCGATCATTCAGTGTGTTCTCCGAAACGAACATGAAGGAAGAAGCGACAGAATTGGCGTTGGTTTCGAATGGCTGCGTGGATTATAAAGGGAGGATTGCAAGTAAACAAGCTACTGGAGGATGGAAAGCCTCCCCATTCATAATAGTGAATGAGGTTGCAGAGAGACTGGCATTCTTTGCAGTTGCTGTGAACATGGTGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010770
ATGGAAATTACAACCGTAAAACAGCGATCATTCAGTGTGTTCTCCGAAACGAACATGAAGGAAGAAGCGACAGAATTGGCGTTGGTTTCGAATGGCTGCGTGGATTATAAAGGGAGGATTGCAAGTAAACAAGCTACTGGAGGATGGAAAGCCTCCCCATTCATAATAGTGAATGAGGTTGCAGAGAGACTGGCATTCTTTGCAGTTGCTGTGAACATGGTGGCTTATCTAGTGAGAGAGATGCATCAGCCATTCCCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794419.1
MEITTVKQRSFSVFSETNMKEEATELALVSNGCVDYKGRIASKQATGGWKASPFIIVNEVAERLAFFAVAVNMVAYLVREMHQPFPDAATHVTDWIGAAYVLTLLGAFLADAYLGRFRTIIIFSGIYAVGMVMLTLSASIDSLRPPRCSQRPCVPSTRRQTAFLYCSLALIAVGTGGIKPCVSSFGADQFDESDSNEAQKKYAFFNWFFFAINMGALVGITLMVYIQDEFGWIWGFGVPTAAMIISMLILAAGFMKYRYQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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