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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003835`

染色体: Chr02 坐标: 60033926-60041498 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003835`
名称	SmilChr02G003835
描述	probable carbohydrate esterase At4g34215
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60033926 - 60041498 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010779`
GeneID	`131010779`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010779`
原始查询	`LOC131010779`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable carbohydrate esterase At4g34215
产物	probable carbohydrate esterase At4g34215
Arabidopsis	`AT3G53010` (AT3G53010) carbohydrate esterase, putative (DUF303) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824467] identity=48.5; qcov=0.923; evalue=2.08e-74; confidence=high
Rice	`Os03g0857500` - identity=47.2; qcov=0.885; evalue=5.01e-69; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03629 (SASA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010779

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057794423.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.80000	`XP_057794423.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057794423.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794423.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794423.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60040147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C21
`Chr2:60040841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:60040844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C83
`Chr2:60040849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B18,B22,C16
`Chr2:60040981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B59
`Chr2:60041077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr2:60041109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr2:60041131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:60041164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:60041181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B58,C77,C9
`Chr2:60041210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B45,C54,C56,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794423.1

261 aa

130

261

SASA

PF03629 SASA 24-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794423.1`	Pfam	`PF03629`	SASA	Domain	24	257	5.7e-79	265.6	Carbohydrate esterase, sialic acid-specific acetylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938440.1
ATCCCAATGGCTTCTCATTCCAAACCATCCAAGGCACTCTGTAGATAGAGGCCAAACAAATAAAGCCTCTTTCAGAATTTGGTTCCGGCCAAAAAATGAATTCCCTTATTTGGCTAACGATTTTGTGCTGCTCATCAACGTTAGTGAGCAGCCAAAACCAACCCCAAAACATATTCATTCTCGCCGGACAAAGCAATATGGCCGGACGCGGCGGGCCAGACGGCCTCGAGGCCAAAGACATGGTGCCTCCGCCGCAATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010779
ATGAATTCCCTTATTTGGCTAACGATTTTGTGCTGCTCATCAACGTTAGTGAGCAGCCAAAACCAACCCCAAAACATATTCATTCTCGCCGGACAAAGCAATATGGCCGGACGCGGCGGGCCAGACGGCCTCGAGGCCAAAGACATGGTGCCTCCGCCGCAATGCAATCCCAACCCGCGCATCCTCCGGTTCAGCAAGGCGGGCGCGTGGGAGGAGGCACGTGACCCGCTCCACCGCGACATCGACATCGGCAAGAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794423.1
MNSLIWLTILCCSSTLVSSQNQPQNIFILAGQSNMAGRGGPDGLEAKDMVPPPQCNPNPRILRFSKAGAWEEARDPLHRDIDIGKKNGVGPGMPFANTLLAKDPSIGVIGLVPCAIGDTALKRWSRGGDLYVTMMERTRAALAGGGVLRGLMWYQGEADSGKMEDATSYKTRFEQFVADVRAELQMPTLPVVQVAINVQLPDYVNTVKALRESQKTANVSNMKTIDAWGLPTVSDKVHLTAESQVKLGQMMADAFLQIAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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