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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003866`

染色体: Chr02 坐标: 60628849-60633566 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003866`
名称	SmilChr02G003866
描述	uncharacterized SmilChr02G003866
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	60628849 - 60633566 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010809`
GeneID	`131010809`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010809`
原始查询	`LOC131010809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L4/L1 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816525]; symbol=AT2G20060; hit=AT2G20060; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal protein L4/L1 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816525]; symbol=AT2G20060; hit=AT2G20060; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G20060` (AT2G20060) Ribosomal protein L4/L1 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816525] identity=72; qcov=1; evalue=8.6e-158; confidence=high
Rice	`Os11g0585700` - identity=78; qcov=0.831; evalue=7.59e-143; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00573 (Ribosomal_L4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010809

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057794454.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794454.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794454.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794454.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794454.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:60629695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr2:60629881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C34,D9
`Chr2:60629921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:60629927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C54,C56,C65
`Chr2:60629949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:60629953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:60629982`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B111,B32,B68,B75,B81,C22,C32,C68,C83
`Chr2:60630654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr2:60631249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B95,C17,C40,D3
`Chr2:60631431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C7
`Chr2:60632736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794454.1

307 aa

154

307

Ribosomal_L4

PF00573 Ribosomal_L4 113-300 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794454.1`	Pfam	`PF00573`	Ribosomal_L4	Family	113	300	1.3e-69	234.4	Ribosomal protein L4/L1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938471.1
TAACTAAAAACAGGCAAAATAGTAGACGCGCGCCGCGCGTGATTGCTCGAGCCCGGCCCGCACCCGTCAAACCCCAGAAAGAAGGGTTTATGGAAGGGCACATCTCTCTCTCGCCAAGACGCTGCTTCCATTTCTATTATCTGCTATCTATGCCGCTGGAATAATATTTCTGGCTTATAAAGGCCCTTTTTTGCCTGGATTTGGAGATGGCTTTGTCGATTTCTAGAAGAGTATTGCGTGCCTTCGCTCCCGGCGATGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010809
ATGGCTTTGTCGATTTCTAGAAGAGTATTGCGTGCCTTCGCTCCCGGCGATGTTTCTTCTCTGCCATTTTCTATATATAATGCATTTCGTGGTCATGATTGTGGTGATAGCTTGCATTCGATGAGATCTTCTGTCCTCGGAAAGGCATCTTTGGATGTTTGTCGGAGGTACTCTACTACTATTTTGACCCCGAATTCAAGTGAAGGCACATTTCCCTCGCATTTGTTGTCCTCTAAAACTAAAAGTGTGCTCATTCCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794454.1
MALSISRRVLRAFAPGDVSSLPFSIYNAFRGHDCGDSLHSMRSSVLGKASLDVCRRYSTTILTPNSSEGTFPSHLLSSKTKSVLIPDREIGLCQDLVFPVTNFLNEDKGFMTLGGDVFDVPIRKDIIHRVVRWQLAKRRQGTHSTKTISEVSGTGRKPWNQKGLGRARHGTLRGPQFRGGAIMHGPKPRSHAIKLNKKVRRLGLKIALSARAAEGKLMVFEDLDVPTHKTKNIVNFVSQMENAKKILLVDGGPINEKLKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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