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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003903`

染色体: Chr02 坐标: 61114442-61115851 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003903`
名称	SmilChr02G003903
描述	photosystem I chlorophyll a/b-binding protein 5, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61114442 - 61115851 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010847`
GeneID	`131010847`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010847`
原始查询	`LOC131010847`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosystem I chlorophyll a/b-binding protein 5, chloroplastic
产物	photosystem I chlorophyll a/b-binding protein 5%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G45474` (Lhca5) photosystem I light harvesting complex protein 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841099] identity=73.7; qcov=0.915; evalue=1.43e-131; confidence=high
Rice	`Os02g0764500` - identity=69.5; qcov=0.874; evalue=1.87e-119; confidence=high
GO	GO:0009416 (response to light stimulus); GO:0009768 (photosynthesis, light harvesting in photosystem I); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00196 (Photosynthesis - antenna proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00504 (Chloroa_b-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010847

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057794506.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057794506.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057794506.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794506.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794506.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61115208`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794506.1

270 aa

135

270

Chloroa_b-bind

PF00504 Chloroa_b-bind 70-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794506.1`	Pfam	`PF00504`	Chloroa_b-bind	Family	70	238	1.6e-47	162.7	Chlorophyll A-B binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938523.1
TCTTGATTATTTGTGGACCTTGTTTTTTGCATTTATTTTGCTGAGTACTTTAGCAAGAAGTTTGGAAATATGAGGTAAGAAAATGATGCAGATAGCAGTGGGAAGAGGGATTCAAATGTTGGCTTACTCTGGCTCCTTCCCATTCACTGTTAAAAGCAGAGACAGAACTTCCTTCACCAGATCAAATGGTGGCTGGCTTGTGAAGAAGGGTGCAGGTTCTGCCCCGAACCACCACCGCGTGGTGGTGGTTCGAGCTCAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010847
ATGATGCAGATAGCAGTGGGAAGAGGGATTCAAATGTTGGCTTACTCTGGCTCCTTCCCATTCACTGTTAAAAGCAGAGACAGAACTTCCTTCACCAGATCAAATGGTGGCTGGCTTGTGAAGAAGGGTGCAGGTTCTGCCCCGAACCACCACCGCGTGGTGGTGGTTCGAGCTCAGGACCGGCCCACGTGGCTCCCCGGCCTCGACCCTCCACCTTATCTCGATGGAACACTAGCTGGAGATTTTGGGTTCGATCCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794506.1
MMQIAVGRGIQMLAYSGSFPFTVKSRDRTSFTRSNGGWLVKKGAGSAPNHHRVVVVRAQDRPTWLPGLDPPPYLDGTLAGDFGFDPLGLGEDPDSLKWYVQAELVHARFAMAGVAGILATDLLRVTGIRNLPVWYEAGATKFSFASTRTLIIVQLLLMGFAETKRYMDFKTPGSQAKDGSFFGLEASFQGLEPGYPGGPLLNPLGLAKDIKNAHEWKLKEIKNGRLAMVAILGIFVQANVTHVGPIDNLIQHLSNPWHTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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