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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003908`

染色体: Chr02 坐标: 61134789-61138709 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003908`
名称	SmilChr02G003908
描述	protein TIC 22, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61134789 - 61138709 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010850`
GeneID	`131010850`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010850`
原始查询	`LOC131010850`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIC 22, chloroplastic
产物	protein TIC 22%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G33350` (Tic22-IV) Tic22-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829471] identity=59.6; qcov=1.05; evalue=2.07e-95; confidence=high
Rice	`Os07g0290800` (P0656C04.101) - identity=42.4; qcov=0.564; evalue=5.46e-26; confidence=medium
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0015031 (protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF04278 (Tic22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010850

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057794508.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057794508.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057794510.1`
4	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057794508.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794508.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61136059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:61136214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B122
`Chr2:61136907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,C23
`Chr2:61138170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:61138215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B50,B53,C23
`Chr2:61138353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:61138461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C8
`Chr2:61138468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr2:61138479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794508.1

278 aa

139

278

Tic22

PF04278 Tic22 17-274 aa

XP_057794509.1

278 aa

139

278

Tic22

PF04278 Tic22 17-274 aa

XP_057794510.1

234 aa

117

234

Tic22

PF04278 Tic22 17-192 aa PF04278 Tic22 192-230 aa

XP_057794511.1

234 aa

117

234

Tic22

PF04278 Tic22 17-192 aa PF04278 Tic22 192-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794508.1`	Pfam	`PF04278`	Tic22	Family	17	274	2.3e-107	358.6	Tic22-like family
`XP_057794509.1`	Pfam	`PF04278`	Tic22	Family	17	274	2.3e-107	358.6	Tic22-like family
`XP_057794510.1`	Pfam	`PF04278`	Tic22	Family	17	192	3e-79	266.5	Tic22-like family
`XP_057794510.1`	Pfam	`PF04278`	Tic22	Family	192	230	3e-79	266.5	Tic22-like family
`XP_057794511.1`	Pfam	`PF04278`	Tic22	Family	17	192	3e-79	266.5	Tic22-like family
`XP_057794511.1`	Pfam	`PF04278`	Tic22	Family	192	230	3e-79	266.5	Tic22-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938526.1
GAACTCACAGCCCGAGGTTACTTACACACAAGCGTCCGTTCAGGACTAAGAACTTAGGCCCTTAAGATAGTAGCCCAATAAAGTAGCAAAATAGGCCCAGTTTAATAATCCGAATAATATTACTAGAAATTCCACAGTGCAAGTGTGGGAACGACAATGGAGTCATCTTCTGCAAAACCCTCGGTGGGTCCACCTCCCAATCCCCTTCTCCCCCTCTCTACCTTCTTCCACCGAGTCGGCACTCAGCTCGCCACTCGACT...

XM_057938528.1
AGTTTAATAATCCGAATAATATTACTAGAAATTCCACAGTGCAAGTGTGGGAACGACAATGGAGTCATCTTCTGCAAAACCCTCGGTGGGTCCACCTCCCAATCCCCTTCTCCCCCTCTCTACCTTCTTCCACCGAGTCGGCACTCAGCTCGCCACTCGACTCGACGACGCCAAGCGGTTCGCCGGAGCTGCTCTGCTGGCTCCGCCTCCGCTGCCGCGGCTATCCTTGCCTTTCGCTTCCGTGTCGCAGCGCCAGGGGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131010850
ATGGAGTCATCTTCTGCAAAACCCTCGGTGGGTCCACCTCCCAATCCCCTTCTCCCCCTCTCTACCTTCTTCCACCGAGTCGGCACTCAGCTCGCCACTCGACTCGACGACGCCAAGCGGTTCGCCGGAGCTGCTCTGCTGGCTCCGCCTCCGCTGCCGCGGCTATCCTTGCCTTTCGCTTCCGTGTCGCAGCGCCAGGGGAAGCAGGCGGCTGCACCAGAGGCGTCGTTCAATTCGGAGCATGTAGCTAGGAGGCTCTC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057794508.1
MESSSAKPSVGPPPNPLLPLSTFFHRVGTQLATRLDDAKRFAGAALLAPPPLPRLSLPFASVSQRQGKQAAAPEASFNSEHVARRLSGTSVYTVSNTNNEFVLISDPDGVKSIGLLCFRREDAEAFLAQVRSRRGEVKGGAKVVPITLDQVYMLKVEGIAFRFLPDPVQIKNALEIRASDVKSGFDGVPVFQSDLLVVKKKNKRYCPIYFQKEDIEKALSTVSRASRGPGLSQHILVGSLEDVLRKMEISKKNSGWEDLI...

XP_057794509.1
MESSSAKPSVGPPPNPLLPLSTFFHRVGTQLATRLDDAKRFAGAALLAPPPLPRLSLPFASVSQRQGKQAAAPEASFNSEHVARRLSGTSVYTVSNTNNEFVLISDPDGVKSIGLLCFRREDAEAFLAQVRSRRGEVKGGAKVVPITLDQVYMLKVEGIAFRFLPDPVQIKNALEIRASDVKSGFDGVPVFQSDLLVVKKKNKRYCPIYFQKEDIEKALSTVSRASRGPGLSQHILVGSLEDVLRKMEISKKNSGWEDLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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