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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003923`

染色体: Chr02 坐标: 61298190-61301025 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003923`
名称	SmilChr02G003923
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 homolog
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61298190 - 61301025 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010863`
GeneID	`131010863`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010863`
原始查询	`LOC131010863`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 homolog
产物	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 homolog
Arabidopsis	`AT5G23540` (AT5G23540) Mov34/MPN/PAD-1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832420] identity=94.5; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0371200` - identity=94.2; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0008237 (metallopeptidase activity); GO:0008541 (proteasome regulatory particle, lid subcomplex); GO:0016579 (protein deubiquitination); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0070628 (proteasome binding)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01398 (JAB); PF14464 (Prok-JAB); PF23594 (RPN11_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010863

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794530.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057794530.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794530.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057794530.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794530.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61298416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,C23
`Chr2:61299268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:61300553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr2:61300809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794530.1

312 aa

156

312

JAB

Prok-JAB

RPN11_C

PF01398 JAB 30-141 aa PF14464 Prok-JAB 41-131 aa PF23594 RPN11_C 231-310 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794530.1`	Pfam	`PF01398`	JAB	Domain	30	141	5.9e-35	120.3	JAB1/Mov34/MPN/PAD-1 ubiquitin protease
`XP_057794530.1`	Pfam	`PF14464`	Prok-JAB	Family	41	131	1e-06	29.3	Prokaryotic homologs of the JAB domain
`XP_057794530.1`	Pfam	`PF23594`	RPN11_C	Domain	231	310	8e-35	119.4	26S proteasome regulatory subunit RPN11 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938547.1
GGGCACCATTGCAAAATCCCCCAAAAAGACCCACTGTCTTGTTTCCAAAGAAAAGTATTCTTCAAAACTATCTGCTTTAGCAAAAAAATTTGCAAAAGAAAACCGAAGATAATTTTTAAATTGAAAAATTGAAATGGCAGGCATGGAGAGACTTCACCGGATGTTCGCCGGCGCGGGCGGAGCCCTCGGCCATCCTCCGCCGGATTCCCCGACGCTCGACTCCTCCGAACAAGTCTACATTTCGTCTCTCGCCCTTCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010863
ATGGCAGGCATGGAGAGACTTCACCGGATGTTCGCCGGCGCGGGCGGAGCCCTCGGCCATCCTCCGCCGGATTCCCCGACGCTCGACTCCTCCGAACAAGTCTACATTTCGTCTCTCGCCCTTCTCAAGATGCTCAAACACGGTAGAGCCGGGGTGCCGATGGAGGTGATGGGGCTGATGCTGGGGGAGTTTGTGGACGAGTACACGGTGCGTGTGGTGGACGTCTTCGCGATGCCGCAGAGTGGAACCGGTGTCAGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794530.1
MAGMERLHRMFAGAGGALGHPPPDSPTLDSSEQVYISSLALLKMLKHGRAGVPMEVMGLMLGEFVDEYTVRVVDVFAMPQSGTGVSVEAVDHVFQTNMLDMLKQTGRPEMVVGWYHSHPGFGCWLSGVDINTQQSFEALNQRAVAVVVDPIQSVKGKVVIDAFRLINPQTMMLGQEPRQTTSNVGHLNKPSIQALIHGLNRHYYSIAINYRKNELEEKMLLNLHKKKWTDGLTLQRFDSHSKTNEQTVQEMLNLAIKYNK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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