当前解析结果
SmilChr02G003922| 统一新 Gene ID | SmilChr02G003922 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G003922 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G003922 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 61292096 - 61295382 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131010864 |
|---|---|
| GeneID | 131010864 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010864 |
| 原始查询 | LOC131010864 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0761500; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os02g0761500; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os02g0761500- identity=40.1; qcov=0.874; evalue=2.78e-27; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010864 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057794531.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057794531.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057794531.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057794531.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057794531.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:61292381 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B63 |
Chr2:61292412 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B118,C16 |
Chr2:61292412 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B118,C16 |
Chr2:61292427 |
GAT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 99 | A1,A10,A14,A15,A18,A19,A22,A25,A4,A6,B1,B10,B104,B106,B109,B119,B120,B123,B126,B130,B131,B133,B134,B135,B137,B140,B18,B2,B22,B23,B27,B29,B30,B34,B35,B36,B38,B39,B48,B49,B51,B54,B55,B6,B63,B66,B69,B72,B73,B74,B77,B8,B80,B83,B87,B88,B9,B98,B99,C1,C12,C13,C15,C17,C19,C22,C23,C26,C28,C29,C30,C34,C36,C37,C38,C39,C41,C44,C46,C47,C52,C59,C6,C60,C61,C64,C66,C67,C72,C77,C79,C82,C83,C84,C85,C86,C87,D7,D9 |
Chr2:61293463 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B63 |
Chr2:61293465 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。