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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003960`

染色体: Chr02 坐标: 61770549-61774436 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003960`
名称	SmilChr02G003960
描述	uncharacterized SmilChr02G003960
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61770549 - 61774436 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010876`
GeneID	`131010876`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010876`
原始查询	`LOC131010876`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721]; symbol=AT1G40087; hit=AT1G40087; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721]; symbol=AT1G40087; hit=AT1G40087; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G40087` (AT1G40087) Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721] identity=23.4; qcov=0.748; evalue=3.56e-16; confidence=weak
Rice	`Os02g0129000` - identity=23.8; qcov=0.582; evalue=6.46e-13; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010876

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794549.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794549.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794549.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794549.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794549.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61771623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:61772050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B57,B75,C23,C74
`Chr2:61772131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:61772154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr2:61772156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr2:61772157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr2:61772286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B75,C23,C74
`Chr2:61772466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B55,C64
`Chr2:61772489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,C3,C46,C64
`Chr2:61772514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B140,C3,C64
`Chr2:61772592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B101,B140,B22
`Chr2:61772608`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A1,A18,A24,A8,B101,B140,B22,B23,B44,B51,B55,B7,B99,C26,C5,C6,C64,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794549.1

519 aa

260

519

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 277-404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794549.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	277	404	1.8e-23	84.0	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938566.1
CATATAGAAGATTACTAGAGCTGCATGCTCCTAAGTTGTTTGGTGGATTGCTATTCCGATTGAGGCGTTTGAGCTGCACACGAGATACTTGTGAAATTAGCTAGCATTTGTGTTGTAAGTTTGGACCCGAAGAGTTTGAAGTTTGGAATCAAAACGACATAAACTGTAGGGGACTTGTCTATCTAAATGTTTTGATCATGTTTCGATCCAAAGTGACAATATCCCAGTACAAAAAAGGCCCTCCAACAACAAATTGTAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010876
ATGTTTCGATCCAAAGTGACAATATCCCAGTACAAAAAAGGCCCTCCAACAACAAATTGTAGTTCTCTACCGCCACCATCTTCCACATTCTCACAACCTCTTACTATTGATTCACATCATTCTCCAGATTCTATTTTCAACCACTTGCGTCCACCTTCATTAAATAGTAATTACACACAGCTAAGCCCCCTTCGGCATTCACCATCCCACCTTCATTCGTCCTCCGAGACAGATGATAGTGAATCTAACAACAATGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794549.1
MFRSKVTISQYKKGPPTTNCSSLPPPSSTFSQPLTIDSHHSPDSIFNHLRPPSLNSNYTQLSPLRHSPSHLHSSSETDDSESNNNDDNSHVQASESNVLENIEIVDDKGHVKLTRMGMKASDVFKLAKGLRILVNVNEHGQPIRAARRVLTRYMMKLVKQPNLCPPDLNDFNDVKHAFGVELLRAVREKFYIPRHENVDNVLIALMGIKFRNNKYRVRKEIYKKTHARLREKLKAVLEASGVHGEELEHRVTFHEFREDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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