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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003966`

染色体: Chr02 坐标: 61798581-61800037 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003966`
名称	SmilChr02G003966
描述	uncharacterized SmilChr02G003966
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61798581 - 61800037 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010888`
GeneID	`131010888`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010888`
原始查询	`LOC131010888`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0225100; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0225100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G64950` (AT5G64950) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619] identity=23.9; qcov=0.903; evalue=2.19e-34; confidence=weak
Rice	`Os06g0225100` - identity=25.8; qcov=0.874; evalue=1.8e-34; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010888

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057794573.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794573.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794573.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794573.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794573.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61798864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,C70
`Chr2:61798888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:61798967`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A1,B119,B123,B133,B30,B51,B6,B66,B72,B73,B77,B80,C23,C30,C37,C47,C52,C67,C82,C86,D11
`Chr2:61798985`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A18,A20,A24,A25,A7,B107,B108,B109,B127,B129,B133,B2,B20,B3,B47,B59,B64,B66,B91,C10,C18,C25,C5,C81,D2,D4,D5,D9
`Chr2:61798989`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr2:61798989`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr2:61799050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,D11
`Chr2:61799122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C42
`Chr2:61799143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B55,B81,C42,D1
`Chr2:61799169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B55,B81,C42,D1
`Chr2:61799170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B55,B81,C42,D1
`Chr2:61799179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B55,B81,C42,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794573.1

390 aa

195

390

mTERF

PF02536 mTERF 54-164 aa PF02536 mTERF 174-363 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794573.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	54	164	2.9e-32	112.6	mTERF
`XP_057794573.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	174	363	2.9e-32	112.6	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938590.1
AGAACGGGGAGTACTTTAAACCACCTACAAACAACAATAATTAAAAAAAATGTAAAATTTTGAATAAATAAATAAATGAATAAGCAAAGTGAAAATCGAAACACCTCCGCCCTTAAATCTTGTCTAGAAGTAGAACCCTCAAATCTCAGAAAACTTTAAATTCTGCGATTCAATGTCAAGATATTTGACGGTCGAAATCTTTGTCTGCAAATTTTTCTCTCTGCCACTCCATGATTTCATGAAGCCCTGTTCAATCTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010888
ATGTCAAGATATTTGACGGTCGAAATCTTTGTCTGCAAATTTTTCTCTCTGCCACTCCATGATTTCATGAAGCCCTGTTCAATCTGCAAATTCAATGTTCTTTTCTCTCTCTCCCCTCATTTCTTCTCAACAAGGAGCGAGAGCCCCGCAGTCTACGATTTGTTGGTGAACAAACACCACTTTTCACCTCAAGTCGCTTCATCAGTCGCCTCGGATCTAACCCGATCGAGAAGCCCGGAAAAGGCCGACTCAATCCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794573.1
MSRYLTVEIFVCKFFSLPLHDFMKPCSICKFNVLFSLSPHFFSTRSESPAVYDLLVNKHHFSPQVASSVASDLTRSRSPEKADSILSFLTESGFSSTQLEKLVKCKPRILTAPFEDEIRSKFKIFRESGLSPEDIAHITSSNQVILQLSAKNRIVPSLSLLQSFLGSESDHQDVARLLKKCPWFLTVDLGKILMPNVEILKGYGVALADIRRILFCFPRFMLVRPEIMRKSAEKAEEMGASRSSRMFIYGVRSFASMSDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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