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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003958`

染色体: Chr02 坐标: 61746960-61748942 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003958`
名称	SmilChr02G003958
描述	uncharacterized SmilChr02G003958
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61746960 - 61748942 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010897`
GeneID	`131010897`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010897`
原始查询	`LOC131010897`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsVQ33; symbol=OsVQ33; hit=Os08g0409500; species=rice; confidence=weak
产物	OsVQ33; symbol=OsVQ33; hit=Os08g0409500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G35830` (AT1G35830) VQ motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840485] identity=36.8; qcov=0.701; evalue=1.28e-21; confidence=medium
Rice	`Os08g0409500` (OsVQ33) - identity=64; qcov=0.249; evalue=5.95e-22; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05678 (VQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010897

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794583.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794583.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794583.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794583.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794583.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61747320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr2:61747385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:61747437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr2:61747455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B6,B97,C78
`Chr2:61747485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,D3
`Chr2:61747535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B91,B95,C14,C18
`Chr2:61747592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B40,C86,D6
`Chr2:61747821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B30,B45
`Chr2:61747832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B121,B30,B90,C59
`Chr2:61747841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B30,B90,C59
`Chr2:61747846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B30,B90,C59
`Chr2:61747867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B120,B30,B90,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794583.1

345 aa

172

345

PF05678 VQ 129-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794583.1`	Pfam	`PF05678`	VQ	Motif	129	156	1.6e-11	44.2	VQ motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938600.1
TTTCCTTCATTTCACACTCAACATCAAACTGGCCAACCATTTTTCTCTCACTTTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAGTTTGACCCGTCGCCACCTACCGGCAGCTTCCTTCCTCTGCTCCAATGGCGGACCCACCACCCCCACAATTTTCTCTGTCTCTTTTCATTTAATGGCGTAAAAAAAATGCAAGCTTTTTAACTGCCTTTGTTTGAGAGCCACCACTTATTTAATCTTTCTTCTTCTCTTCTTTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010897
ATGGATTCCGGCAATAGTGGGAGTATGCAGTCCTCCAGCGGCGGCGACGATCAGGAATTTGATTCGAGCTCCTCTTTCCTGAACCCCCCTCACCATTTCGGCTCAATCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGCGCCGCAGTTTCTCTCTCATCAAAACCCCAATTTCTTCGACCCTAATCCCTCACAGAATCTCGATCACGGTGGCGGATACGCCAACGACAGCGATCTGATTTGGTCGAGGGGATTGAGATCCGACAATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794583.1
MDSGNSGSMQSSSGGDDQEFDSSSSFLNPPHHFGSISAAAAAAAPQFLSHQNPNFFDPNPSQNLDHGGGYANDSDLIWSRGLRSDNHAFSNLGNSPLPSRPQQIPAAPPPQQQASAARNPKKRTRASRRAPTTVLTTDTTNFRQMVQEFTGIPAAPFSGSSPYSRRLDLFSAASALRSAAHLDGLGPLYPLRPAAHKIMSPFSSSSAVPPPLLNSTMIDAIVPTTTITNTNSASTSNIDPNNFQLYQHGINNQQMNFSNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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