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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003937`

染色体: Chr02 坐标: 61449314-61450613 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003937`
名称	SmilChr02G003937
描述	protein PHOSPHATE-INDUCED 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61449314 - 61450613 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010903`
GeneID	`131010903`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010903`
原始查询	`LOC131010903`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PHOSPHATE-INDUCED 1-like
产物	protein PHOSPHATE-INDUCED 1-like
Arabidopsis	`AT4G08950` (EXO) Phosphate-responsive 1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826473] identity=71.9; qcov=0.917; evalue=1.52e-152; confidence=high
Rice	`Os02g0757100` (OsPHI-1) - identity=62.4; qcov=0.949; evalue=2.28e-129; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04674 (Phi_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010903

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057794588.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057794588.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794588.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794588.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794588.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61449455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:61449457`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	B102,B124,B15,B20,B21,B25,B27,B28,B32,B34,B76,C14,C25,C40,C63,C78,C83,C85,D9
`Chr2:61449475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C8
`Chr2:61449506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr2:61449621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:61449623`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C55
`Chr2:61449623`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C55
`Chr2:61449627`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C55
`Chr2:61449627`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C55
`Chr2:61449641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:61449667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B7
`Chr2:61449821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794588.1

314 aa

157

314

Phi_1

PF04674 Phi_1 38-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794588.1`	Pfam	`PF04674`	Phi_1	Family	38	313	1.4e-123	412.4	Phosphate-induced protein 1 conserved region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938605.1
CCTTTTTCTAAAACGCCTACCAGACTTACACTGCTCCTACTAATTAAACCGCGTTTTCCAGTTATCCCCCCTTTCTCACCACCTTCTCTCATCTCATCTCATACTCATACACGTAAATCCATGTTTAACAATTTTCAATTGTATAAATACCATCCCCCACCTCCTCCAATCCTCATCCAAACATCTCCTCCTCTCTCTACAACTCTCTCTCACTTCACTTTCAAATGGCTTCTTCCACCATTCTCAATCTGCTAGCCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010903
ATGGCTTCTTCCACCATTCTCAATCTGCTAGCCATTTTCTCTCTCTTGAATGTGTGCTTCGCTTCAAGAGCAATCCCCAGTTCTCTAGTTGAAGACTCACAAACCCAGCTGCTCAAATATCACAAGGGCGCACTTCTCCAAGGCAGAATCTCAGTTAACCTAATTTGGTATGGCAAATTCACCCCTTCTCAGAGGGCAATCGTCGCTGATTTCATCACATCTCTTACCCCTAATTCATCGCCATCGCAATCCCAGCCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794588.1
MASSTILNLLAIFSLLNVCFASRAIPSSLVEDSQTQLLKYHKGALLQGRISVNLIWYGKFTPSQRAIVADFITSLTPNSSPSQSQPSVAAWWKTTEKYYHLATSKKPSLSLYLNKQILDDSYSIGKSLTESQLVLLASKGEQMNAINVVLTASDVAVDGFCQNRCGTHGSKSTAVKGKNQKFAYIWVGNSETQCPGYCAWPFHQPIYGPQTPPLVAPNNDVGVDGMVINLSGLLAGTATNPFGNGFYQGPADAPLEAATA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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