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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003959`

染色体: Chr02 坐标: 61769131-61770352 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003959`
名称	SmilChr02G003959
描述	uncharacterized SmilChr02G003959
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	61769131 - 61770352 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010913`
GeneID	`131010913`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010913`
原始查询	`LOC131010913`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0768600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0768600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0768600` - identity=40.5; qcov=1.03; evalue=4.92e-50; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010913

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794604.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057794604.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794604.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794604.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794604.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:61769549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A16,A18,A2,A4,A5,A7,A8,B1,B111,B118,B121,B30,B39,B48,B54,B59,B83,B86,B89,B92,C21,C26,C39,C4,C41,C44,C45,C52,C54,C61,C64,C66,C68,C81,C85
`Chr2:61769585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr2:61769609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C13
`Chr2:61769618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C21,C45
`Chr2:61769816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:61769850`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A10,A16,A19,A20,B105,B110,B113,B125,B13,B133,B27,B4,B41,B45,B50,B54,B57,B61,B64,B67,B68,B75,B86,B9,B99,C12,C17,C21,C23,C25,C30,C34,C36,C4,C46,C49,C54,C6,C67,C71,C74
`Chr2:61769907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C25
`Chr2:61770047`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B33
`Chr2:61770047`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B33
`Chr2:61770070`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A22,B130,B137,B16,B58,B65,C34,C57,C7
`Chr2:61770134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B62,C45,C59,C83
`Chr2:61770138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,A8,B103,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794604.1

234 aa

117

234

DUF4216

PF13952 DUF4216 139-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794604.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	139	212	2.7e-19	70.2	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938621.1
ATCTTTTTGTATATCATTTCAAGGTTTTTGGCCCATTTAAAGTCTTATGTTCGAAATAGAGCTCAACCTGAAGGATCAATTGCAGAGGGGTATATCGCTGATGAGTGCCTCACCTTTTGTTCAAGATATTTTGAAGGCATTGAGACTCGATTCAATCGGCCTCGTAGATACGATGATACCATCTTAAACAAGGAAAAATATTTTTTCAAGTCTGGAGGTAGAGCTGTTGGAAAAGTTGAAATCATGAAACTTGATGAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010913
ATGAAACTTGATGAGTTATCATTGGCTCAAGCACATCGCTATGTGTTACTACAAAGTCCTAAGATTTTTTCATATTTAGAGCATTTCCTAAAGCAGCGAAGAAACATGCACCATGGACAAGTTAATCAAAATGTGGAGAATAAGTGGGTAGTTGAGGAGTTTCCTGGTTGGCTTCAACAACAGGTTCCAATAATGGAGAAACATCATTGTGACGAAGAAACAGTAGCCCTCGCAAGAGGGCCAAACAGTTATGCAAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794604.1
MKLDELSLAQAHRYVLLQSPKIFSYLEHFLKQRRNMHHGQVNQNVENKWVVEEFPGWLQQQVPIMEKHHCDEETVALARGPNSYAKRYKAFMINGFKFHTKDQEIYRKTQNSGVVVEVKEGDEENIVKKYYGSIIDIYELDYYGKGNVVIFRCDWVNINSSSGLKKDKYGLPLVSFSRLIHTGEALKDDPFVLSTNAKQVFYVQDGKESEWMHIVETKPRDLYDMGSNLEEGFI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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