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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003990`

染色体: Chr02 坐标: 62191665-62193384 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003990`
名称	SmilChr02G003990
描述	60S ribosomal protein L30-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62191665 - 62193384 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010922`
GeneID	`131010922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010922`
原始查询	`LOC131010922`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L30-like
产物	60S ribosomal protein L30-like
Arabidopsis	`AT1G36240` (AT1G36240) Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840530] identity=88.5; qcov=1; evalue=3.27e-70; confidence=high
Rice	`Os01g0812800` - identity=77.7; qcov=0.991; evalue=4.56e-63; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01248 (Ribosomal_L7Ae)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794613.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057794613.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794613.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794613.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794613.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62191882`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	152	A1,A14,A15,A16,A18,A20,A22,A23,A25,A4,A5,A8,A9,B10,B101,B102,B103,B104,B107,B108,B109,B114,B115,B118,B119,B12,B120,B122,B124,B125,B126,B128,B129,B131,B132,B133,B135,B137,B139,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B26,B28,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B44,B46,B47,B5,B51,B52,B53,B54,B56,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B67,B69,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B80,B81,B83,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B95,B96,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C24,C25,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C40,C43,C47,C49,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C58,C60,C64,C65,C66,C70,C73,C75,C78,C79,C8,C83,C84,C87,D1,D10,D11,D2,D3,D7
`Chr2:62191896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B84,C26
`Chr2:62192094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794613.1

117 aa

117

Ribosomal_L7Ae

PF01248 Ribosomal_L7Ae 14-101 aa

XP_057794614.1

113 aa

113

Ribosomal_L7Ae

PF01248 Ribosomal_L7Ae 14-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794613.1`	Pfam	`PF01248`	Ribosomal_L7Ae	Domain	14	101	1.3e-22	80.0	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family
`XP_057794614.1`	Pfam	`PF01248`	Ribosomal_L7Ae	Domain	14	106	1.6e-24	86.1	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938631.1
TTCTAATTTTGGGTCAAATGAACCAAACAAGGGCCCATTTAAGAATTAAATTAAAATCAAAACACACACTCCATAAACCCTAACCATCTTAACCAATTATTCCCCGTTCCTCCCATAGCCGCCGCCGCCGCTCTTCCCAGTCTCCACCATGGTGGCCGCCGGGAAAAAGACTAAGAAGACCCATGAGAGCATCAACAACAGGCTGGCTCTTGTGATGAAGAGTGGGAAGTTCACTCTTGGTTACAAGACTGTGCTCAAGA...

XM_057938630.1
GTCAAATGAACCAAACAAGGGCCCATTTAAGAATTAAATTAAAATCAAAACACACACTCCATAAACCCTAACCATCTTAACCAATTATTCCCCGTTCCTCCCATAGCCGCCGCCGCCGCTCTTCCCAGTCTCCACCATGGTGGCCGCCGGGAAAAAGACTAAGAAGACCCATGAGAGCATCAACAACAGGCTGGCTCTTGTGATGAAGAGTGGGAAGTTCACTCTTGGTTACAAGACTGTGCTCAAGACTCTCAGGAATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131010922
ATGGTGGCCGCCGGGAAAAAGACTAAGAAGACCCATGAGAGCATCAACAACAGGCTGGCTCTTGTGATGAAGAGTGGGAAGTTCACTCTTGGTTACAAGACTGTGCTCAAGACTCTCAGGAATTCCAAAGGTAAATTGATATTGATATCCAACAACTGCCCACCATTAAGGAAGTCTGAGATTGAATACTATGCAATGCTTGCTAAAGTTGGTGTTCATCACTATAATGGCAACAATGTTGATCTTGGGACGGCATGTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057794613.1
MVAAGKKTKKTHESINNRLALVMKSGKFTLGYKTVLKTLRNSKGKLILISNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGNNVDLGTACGRYFRVSCLSIVDPGITPSLYILTAAHSLNS

XP_057794614.1
MVAAGKKTKKTHESINNRLALVMKSGKFTLGYKTVLKTLRNSKGKLILISNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGNNVDLGTACGRYFRVSCLSIVDPGDSDIIKSLPGDH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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