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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G003994`

染色体: Chr02 坐标: 62259906-62277682 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G003994`
名称	SmilChr02G003994
描述	low affinity sulfate transporter 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62259906 - 62277682 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010929`
GeneID	`131010929`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010929`
原始查询	`LOC131010929`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	low affinity sulfate transporter 3
产物	low affinity sulfate transporter 3
Arabidopsis	`AT5G10180` (SULTR2;1) slufate transporter 2;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830882] identity=59.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0195300` (OsSultr2) - identity=57.8; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008271 (secondary active sulfate transmembrane transporter activity); GO:0008272 (GO:0008272); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00916 (Sulfate_transp); PF01740 (STAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010929

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057794619.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794619.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794619.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794619.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794619.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62260172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,C64,C66,C79
`Chr2:62260724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C66,C79
`Chr2:62261472`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C57
`Chr2:62261472`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C57
`Chr2:62261515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:62262265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,C23,C82,C86
`Chr2:62262390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:62262395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:62262410`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B58,C35
`Chr2:62262410`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B58,C35
`Chr2:62274626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B48,B89,C87
`Chr2:62274728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794619.1

660 aa

330

660

Sulfate_transp

STAS

PF00916 Sulfate_transp 88-476 aa PF01740 STAS 529-646 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794619.1`	Pfam	`PF00916`	Sulfate_transp	Family	88	476	2.4e-132	442.0	Sulfate permease family
`XP_057794619.1`	Pfam	`PF01740`	STAS	Domain	529	646	2.9e-23	82.4	STAS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938636.1
TTATAAACAGCGTGGCGCTTTCAAGGCCCCTCACGCATGGAGGATTTGTATTTAAAGTGCCATAACAGAATCTTCTATCTCTAACTCTCCTTCCTTGGCTTGGGTTCCCCCAAACACTTCAAATTAACACTAGGCAGTATCCATGGCGTCCACCACGCCAGCTGCCGAAATGGAGCTACAGCCGGTGAACGCTGTCGCGGCCGCAGCTGCCTCAGAGAGGGCCAAATGGCTGCTCAGCTCTCCCAACCCGCCCTCCCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010929
ATGGCGTCCACCACGCCAGCTGCCGAAATGGAGCTACAGCCGGTGAACGCTGTCGCGGCCGCAGCTGCCTCAGAGAGGGCCAAATGGCTGCTCAGCTCTCCCAACCCGCCCTCCCCTTGGAGGCAGGTCTACAACTCCATGAGAGAGTCAGTGCTGCCCGGAATTAAATCCGGGCAGCAGCCACGTCGGAACAAGCTCCTCGTCTTCCTAGAGGGCTTGTTCCCTATACTTAAGTGGGGCAGAAACTACAAGGCCACCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794619.1
MASTTPAAEMELQPVNAVAAAAASERAKWLLSSPNPPSPWRQVYNSMRESVLPGIKSGQQPRRNKLLVFLEGLFPILKWGRNYKATKFKKDLLAGLTLASLCIPQSIGYANLAKLDPQYGLYASVVPPLIYALMGSSRELAVGPVAVVSLLLSAMVSKLVDPAADPALYRRIIFTVTFFTGAFQAMFGVFRFGFLIDFLSHAAIVGFMGGAAIVIGLQQLKGLLGISHFTSKTDVISVSSAVIEALRHQWYPLNFVLGCS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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