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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004142`

染色体: Chr01 坐标: 59912656-59924584 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004142`
名称	SmilChr01G004142
描述	uncharacterized SmilChr01G004142
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59912656 - 59924584 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010934`
GeneID	`131010934`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010934`
原始查询	`LOC131010934`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821659]; symbol=NADK1; hit=AT3G21070; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	NAD kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821659]; symbol=NADK1; hit=AT3G21070; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G21070` (NADK1) NAD kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821659] identity=50.8; qcov=0.106; evalue=1.53e-08; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010934

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794629.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794629.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794629.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794629.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794629.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59912658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:59912683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,C58,C7
`Chr1:59912729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,D1,D5
`Chr1:59912730`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A11,C47,C58,C7
`Chr1:59912730`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A11,C47,C58,C7
`Chr1:59912735`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A11,B120,B133,B61,C1,C14,C47,C58,C7
`Chr1:59912750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,D1,D5
`Chr1:59912782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B7,B76
`Chr1:59912783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B7
`Chr1:59912790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B125,B7,B76,C83
`Chr1:59912824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B69,B7,B76
`Chr1:59912860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B1,B7,B76,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794629.1

577 aa

288

577

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 340-471 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794629.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	340	471	4.7e-11	43.7	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938646.1
ATGGTTGATCTAAAGATGAACCATGGAGGTGAGGTGCCCAAAGCAGAGTACCCACAAGAAGAATCATCCAGGAGATGTGAGGCTCGTGAGGAATCGAGTCATTATCAACGAACCAGAAGACGCCGGCCCAAGATGCAGGACACTCCTGTAGGGAAGGCCACACTTGAACCAATCCACCCACACAGATTGATTCTCAACCTCGATCAAGCAACTAAATTATCTTCTCTGCATCTTCTCACGCCCCCTTTGCCGTCTATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010934
ATGGTTGATCTAAAGATGAACCATGGAGGTGAGGTGCCCAAAGCAGAGTACCCACAAGAAGAATCATCCAGGAGATGTGAGGCTCGTGAGGAATCGAGTCATTATCAACGAACCAGAAGACGCCGGCCCAAGATGCAGGACACTCCTGTAGGGAAGGCCACACTTGAACCAATCCACCCACACAGATTGATTCTCAACCTCGATCAAGCAACTAAATTATCTTCTCTGCATCTTCTCACGCCCCCTTTGCCGTCTATCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794629.1
MVDLKMNHGGEVPKAEYPQEESSRRCEAREESSHYQRTRRRRPKMQDTPVGKATLEPIHPHRLILNLDQATKLSSLHLLTPPLPSISEISSRAVVLPAARFDLRRLPRRPLRYPSSISASSPHRRLQLPLKVRGPKCARRFAEYGCLDSTSVLSSEKSIEELIQQPPLQGIEDNLIEFSEALRTVAKALRRVTEVTLVGKSEHWTYALNLSPSALHLLKWLSNSTPKSNNFHILATDGRRICWLENGILRPTEKIRRTTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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