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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004002`

染色体: Chr02 坐标: 62351498-62356060 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004002`
名称	SmilChr02G004002
描述	uncharacterized SmilChr02G004002
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62351498 - 62356060 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010938`
GeneID	`131010938`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010938`
原始查询	`LOC131010938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0421300; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os05g0421300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G10200` (AT5G10200) ARM-repeat/Tetratricopeptide repeat (TPR)-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830884] identity=84.3; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0421300` - identity=82.4; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF26524 (ARM_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010938

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057794631.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057794631.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057794631.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794631.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794631.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62353314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:62353839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B101,B62,B64,C12
`Chr2:62353970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C64
`Chr2:62353970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr2:62354017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:62354640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B30
`Chr2:62354825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B35
`Chr2:62354902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:62355056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B69
`Chr2:62355356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C48
`Chr2:62355385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B98
`Chr2:62355401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B14,B27,B81,C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794631.1

607 aa

304

607

ARM_7

PF26524 ARM_7 7-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794631.1`	Pfam	`PF26524`	ARM_7	Repeat	7	244	5e-117	390.2	Plant ARM repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938648.1
GAAAAAAATATGCTGGATAAGTATCTTCGAAAAAAAAATGCCGGATAAGTACTCCATATGATATTTTAATTTTATTTAATTAATGAATTATTAATCAACTGCATCATACAAACACTAGCAGCTGCAACTGCAAGTTTCAACCTTTTTCTCAGAAAATGAAAAAGGAAAAAAGGGTCATTTTTATTGCAAGATCTTCTTTGCTGTCGAGCTGATTAAGTTCATACCGAAAAAAAGGGGCCATCTTTTATCCACTACGTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010938
ATGGAGAAAGCTTCCCCCGATTGTCCATACCCCGGTTGTTTTTTCTGTGTCATGAAAGAAGGGAATCCAAGCAAGCGTAGAGCGAGTTTATTGAAATTCTTCAGAGAACTCCCATCTCAAGATGATGATGGCCAAGTCCTCCCTATTAGCGGCCTTTGGAACACTGCCATGGCGCACCCTAATGATCCCGAGTTCATCGAGTTGGGGATTTTCGAATGCATGGCAGCGCTCATCTGGAAGGGCTTAAAGAACCGGCGCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794631.1
MEKASPDCPYPGCFFCVMKEGNPSKRRASLLKFFRELPSQDDDGQVLPISGLWNTAMAHPNDPEFIELGIFECMAALIWKGLKNRRWLSHDQNIYIPYYAAHIIGSYTMNMEEFAEMAVHAGVIPALVELLRGRLTWVEQRVAVRALGHLATYAATFPAVASHGEILELSMQLAVSSLEIVYTHFYQYVDRRLSYHCDLLTRGMGGVEMESRKAEEWASQLQCWSLQLINCFAFKPEFLPTICKPEFLVKLPGMWGGLVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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