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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004017`

染色体: Chr02 坐标: 62458265-62466463 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004017`
名称	SmilChr02G004017
描述	uncharacterized SmilChr02G004017
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	62458265 - 62466463 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010948`
GeneID	`131010948`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010948`
原始查询	`LOC131010948`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844260]; symbol=AT1G79190; hit=AT1G79190; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844260]; symbol=AT1G79190; hit=AT1G79190; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G79190` (AT1G79190) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844260] identity=50.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0575800` - identity=46.9; qcov=0.164; evalue=3.17e-52; confidence=weak
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006338 (chromatin remodeling); GO:0070209 (GO:0070209)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF21547 (TTI1); PF24173 (TPR_TTI1_N); PF24181 (TPR_TTI1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010948

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794638.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057794638.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057794638.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794638.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:62458488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:62458618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B37,D7
`Chr2:62458623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B37,D7
`Chr2:62458709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr2:62458712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:62458731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:62458779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,D1
`Chr2:62458980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:62459016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:62459027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:62459063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B35
`Chr2:62459444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794638.1

1378 aa

689

1378

TPR_TTI1_N

TTI1

TPR_TTI1_C

PF24173 TPR_TTI1_N 232-477 aa PF21547 TTI1 856-946 aa PF24181 TPR_TTI1_C 1041-1303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794638.1`	Pfam	`PF24173`	TPR_TTI1_N	Repeat	232	477	3.6e-24	86.0	TTI1 N-terminal TPR domain
`XP_057794638.1`	Pfam	`PF21547`	TTI1	Repeat	856	946	1.2e-25	89.9	TELO2-interacting protein 1
`XP_057794638.1`	Pfam	`PF24181`	TPR_TTI1_C	Repeat	1041	1303	4e-10	40.5	TTI1 C-terminal TPR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938655.1
TCCCCATTGCAACAATTCATTCGCTCGACTCTTTGCAGGAGTGGAGTTGCTTCTTCTTCAACAATCAAACATTCCCATTTCCCCCCAAAACTACCGCAGTTTCTGTTATCGCCTGCTTCAGCAATGGCAGAAACGCAAAATCTCGACGGAAATTCAGGAATACGGGGCTCAATTTTAGACGAAGTTGACGAGGAAGACTCTCGAACCAGCGCTCTTTTTCTGGAACTGAAACTCTACTGCGTGCAGCTGCTGGACCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010948
ATGGCAGAAACGCAAAATCTCGACGGAAATTCAGGAATACGGGGCTCAATTTTAGACGAAGTTGACGAGGAAGACTCTCGAACCAGCGCTCTTTTTCTGGAACTGAAACTCTACTGCGTGCAGCTGCTGGACCTCCTTCAGAACCCCGACAAGGATCGTTCCTTTCTCGCTCATCTCCTCCACCTGCTCCGGAAGTCTTCCACGTCCTCTCTCCAGCCCTTATTCGACTTTACTTTGTTCCCATTGCTGCTTCTGTTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794638.1
MAETQNLDGNSGIRGSILDEVDEEDSRTSALFLELKLYCVQLLDLLQNPDKDRSFLAHLLHLLRKSSTSSLQPLFDFTLFPLLLLFDASVKCRSSMKTDSEDNSLASSTSGMEHKVSDSVAEGVVLCLEEVLKKCQLGSIDQMVVILKKLTLGAMLSPLEASEEFREGVIRCFRAVLLNLGPCSDDSCPCKQISNRPILPDEKELQFPGSKEPGHISLSKECSLAFLQSQPASAAIGHWLSLMLKAADIEVTRGHRGSSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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